RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 PRORSD1PA6NEY8 169 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 M0QX08 132 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 IGHV1-46P01743 117 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 UMPSP11172 480 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 GPX2P18283 190 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 FUT1P19526 365 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 WNT5AP41221 380 aa9.52□□□□□ -0.89
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ACTB-209ENST00000473257 COMPP49747 757 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 ARFIP2P53365 341 aa9.52□□□□□ -0.89
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ACTB-209ENST00000473257 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
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ACTB-209ENST00000473257 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
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ACTB-209ENST00000473257 THEM4Q5T1C6 240 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 DCAF12L2Q5VW00 463 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 REP15Q6BDI9 236 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 TMEM53Q6P2H8 277 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 C1QL2Q7Z5L3 287 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 CLDN22Q8N7P3 220 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
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ACTB-209ENST00000473257 OR1J1Q8NGS3 322 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 AKR7LQ8NHP1 331 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 MOSPD2Q8NHP6 518 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 PFN4Q8NHR9 129 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 ZNF519Q8TB69 540 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 SNX33Q8WV41 574 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 ZFAND2BQ8WV99 257 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
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ACTB-209ENST00000473257 MCHR2Q969V1 340 aa9.52□□□□□ -0.89
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ACTB-209ENST00000473257 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 ZNF385DQ9H6B1 395 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 TMEM38AQ9H6F2 299 aa9.52□□□□□ -0.89
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ACTB-209ENST00000473257 RAB21Q9UL25 225 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 ANGPT4Q9Y264 503 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 LOC100509620A0A075B734 347 aa9.51□□□□□ -0.89
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ACTB-209ENST00000473257 A0A0X1KG70 313 aa9.51□□□□□ -0.89
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ACTB-209ENST00000473257 BPIFB2Q8N4F0 458 aa9.51□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa9.51□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
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ACTB-209ENST00000473257 PRSS27Q9BQR3 290 aa9.51□□□□□ -0.89
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ACTB-209ENST00000473257 NANSQ9NR45 359 aa9.51□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 DECR2Q9NUI1 292 aa9.51□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 TRIM33Q9UPN9 1127 aa9.51□□□□□ -0.89
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ACTB-209ENST00000473257 EVPLLA8MZ36 301 aa9.5□□□□□ -0.89
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ACTB-209ENST00000473257 PRSS23O95084 383 aa9.5□□□□□ -0.89
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ACTB-209ENST00000473257 BCL10O95999 233 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 NGFP01138 241 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 IGHG1P01857 330 aa9.5□□□□□ -0.89
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