RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466636.1

SRPRB-202, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene SRPRB, Length 917 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-202ENST00000466636 RERGLQ9H628 205 aa8.5□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 WDR76Q9H967 626 aa8.5□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 TRIM36Q9NQ86 728 aa8.5□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa8.5□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 KCNMB2Q9Y691 235 aa8.5□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 SLC35F4A4IF30 521 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 CENPBD1B2RD01 187 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 OGG1O15527 345 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 KLK10O43240 276 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 CXCL13O43927 109 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 ABHD16AO95870 558 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 IGHG1P01857 330 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF708P17019 499 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF43P17038 809 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 CD53P19397 219 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 CELP19835 753 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 ALOX5APP20292 161 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 CLDN18P56856 261 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 CARD18P57730 90 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 TAS2R43P59537 309 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 PPIAP62937 165 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 FABP5Q01469 135 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 SLC17A1Q14916 467 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 HIST3H3Q16695 136 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 EGFL6Q8IUX8 553 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 UBQLNLQ8IYU4 475 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 FAM109AQ8N4B1 249 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 ZIC4Q8N9L1 334 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 SLC26A10Q8NG04 563 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 OR9K2Q8NGE7 335 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 OR6N2Q8NGY6 317 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 OR10D3Q8NH80 312 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 OTOSQ8NHW6 89 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 TBC1D15Q8TC07 691 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 SNX33Q8WV41 574 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 TMEM203Q969S6 136 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 PELI1Q96FA3 418 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 DACH2Q96NX9 599 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 FOXN4Q96NZ1 517 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 SCNM1Q9BWG6 230 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 ACKR4Q9NPB9 350 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 SSR3Q9UNL2 185 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 CSAG2Q9Y5P2 127 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa8.49□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF292O60281 2723 aa8.48□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 PTPRBP23467 1997 aa8.48□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa8.48□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF716A6NP11 495 aa8.48□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 PHYHO14832 338 aa8.48□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 PLPP2O43688 288 aa8.48□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 MPZL1O95297 269 aa8.48□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 GALP22466 123 aa8.48□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 RPS27P42677 84 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 SERPINB10P48595 397 aa8.48□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 ENTPD1P49961 510 aa8.48□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 CLDN17P56750 224 aa8.48□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 CLRN1P58418 232 aa8.48□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 TUBA1BP68363 451 aa8.48□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 GLO1Q04760 184 aa8.48□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 EGR3Q06889 387 aa8.48□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 CAMK2DQ13557 499 aa8.48□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 CDK5R1Q15078 307 aa8.48□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 BCL2A1Q16548 175 aa8.48□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 PCK2Q16822 640 aa8.48□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 DGUOKQ16854 277 aa8.48□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 TEX30Q5JUR7 227 aa8.48□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 RNFT1Q5M7Z0 435 aa8.48□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 THEM4Q5T1C6 240 aa8.48□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 OTPQ5XKR4 325 aa8.48□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 CARD17Q5XLA6 110 aa8.48□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 ARL9Q6T311 187 aa8.48□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 RPTNQ6XPR3 784 aa8.48□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa8.48□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 TUBA1AQ71U36 451 aa8.48□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 DPY19L4Q7Z388 723 aa8.48□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 SLC22A16Q86VW1 577 aa8.48□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 TMEM123Q8N131 208 aa8.48□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 RPS4Y2Q8TD47 263 aa8.48□□□□□ -1.05
SRPRB-202ENST00000466636 TMEM54Q969K7 222 aa8.48□□□□□ -1.05
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