RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM171Q8WVE6 324 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF566Q969W8 418 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 ITPKCQ96DU7 683 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 Q96M85 177 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 NSMCE2Q96MF7 247 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 FOXN4Q96NZ1 517 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 DHRS9Q9BPW9 319 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 TXNIPQ9H3M7 391 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM38BQ9NVV0 291 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 IL20RAQ9UHF4 553 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 RPS6KA6Q9UK32 745 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 MGAT4BQ9UQ53 548 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 POFUT2Q9Y2G5 429 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 CSPG4Q6UVK1 2322 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1W2PRG6 482 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1W2PRQ8 180 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 SH3PXD2BA1X283 911 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 EFCAB9A8MZ26 197 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 NDUFAB1O14561 156 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 ACOT8O14734 319 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 GPRIN2O60269 458 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 GPANK1O95872 356 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHG1P01857 330 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 SAGP10523 405 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 CCL2P13500 99 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF35P13682 527 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 CALB2P22676 271 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 RRM2P31350 389 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 THBS4P35443 961 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 CAPZA2P47755 286 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP5J2P56134 94 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 CLRN1P58418 232 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 RPL27P61353 136 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB1AP62820 205 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 SPIBQ01892 262 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 TNK1Q13470 666 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 DGCR6Q14129 220 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 C3orf36Q3SXR2 165 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 ZBED5Q49AG3 693 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 MESTQ5EB52 335 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM255AQ5JRV8 349 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 FGD3Q5JSP0 725 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 C10orf128Q5T292 105 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 SHEQ5VZ18 495 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 VHLLQ6RSH7 139 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 UGT2A3Q6UWM9 527 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 DNM1P46Q6ZS02 220 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 PTCHD4Q6ZW05 846 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 Q71RC1 249 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 OAFQ86UD1 273 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 LRP11Q86VZ4 500 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 MUC15Q8N387 334 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRC18Q8N456 261 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC22A24Q8N4F4 322 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM169BQ8N8A8 192 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 NOXO1Q8NFA2 376 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 OR4K5Q8NGD3 323 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 NSMAFQ92636 917 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 RASD2Q96D21 266 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 THTPAQ9BU02 230 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 KATNB1Q9BVA0 655 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 CACNG6Q9BXT2 260 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 IL1RAPQ9NPH3 570 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 OBP2BQ9NPH6 170 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 CBLN4Q9NTU7 201 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 ACTR3BQ9P1U1 418 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 POU2F3Q9UKI9 436 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A096LNT2 108 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 NPIPB13A6NJU9 1138 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 NPIPB4C9JG80 1138 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 H7C1Q1 480 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 DCTN6O00399 190 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 ARHGEF9O43307 516 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 GADD45GO95257 159 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 MPZL1O95297 269 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 CD14P08571 375 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 MAGEA2P43356 314 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 GIPRP48546 466 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 GSSP48637 474 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC9A3P48764 834 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 ERFP50548 548 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 HMGA2P52926 109 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 ERVS71-1P61550 626 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms