RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 IL20RAQ9UHF4 553 aa3.33□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF639Q9UID6 485 aa3.33□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP3.33□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 HYOU1Q9Y4L1 999 aa3.33□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 DNAH7Q8WXX0 4024 aa3.33□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 UBR4Q5T4S7 5183 aa3.33□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa3.32□□□□□ -1.88
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ECHDC1-211ENST00000460558 TRIM49D1C9J1S8 452 aa3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 PDLIM1O00151 329 aa3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 AP3B1O00203 1094 aa3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 PLPP1O14494 284 aa3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 CTDSP2O14595 271 aa3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 PGRMC2O15173 223 aa3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC25A17O43808 307 aa3.32□□□□□ -1.88
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ECHDC1-211ENST00000460558 FZD7O75084 574 aa3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 NKX2-2O95096 273 aa3.32□□□□□ -1.88
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ECHDC1-211ENST00000460558 ATP1B1P05026 303 aa3.32□□□□□ -1.88
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ECHDC1-211ENST00000460558 APRTP07741 180 aa3.32□□□□□ -1.88
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ECHDC1-211ENST00000460558 OR12D1P0DN82 309 aa3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM11P17152 192 aa3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 MPGP29372 298 aa3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 SERPINB1P30740 379 aa3.32□□□□□ -1.88
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ECHDC1-211ENST00000460558 CD80P33681 288 aa3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 RPL4P36578 427 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 TGFBR2P37173 567 aa3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 FDFT1P37268 417 aa3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 GP5P40197 560 aa3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 CRYBB2P43320 205 aa3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 HNMTP50135 292 aa3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 ARFIP1P53367 373 aa3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 SARNPP82979 210 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
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ECHDC1-211ENST00000460558 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 HIKESHIQ53FT3 197 aa3.32□□□□□ -1.88
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ECHDC1-211ENST00000460558 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa3.32□□□□□ -1.88
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ECHDC1-211ENST00000460558 NPSR1Q6W5P4 371 aa3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF788Q6ZQV5 615 aa3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 NDUFA11Q86Y39 141 aa3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 HSCBQ8IWL3 235 aa3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 KLHDC1Q8N7A1 406 aa3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 SPERTQ8NA61 448 aa3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 OR52E4Q8NGH9 312 aa3.32□□□□□ -1.88
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ECHDC1-211ENST00000460558 VSTM2LQ96N03 204 aa3.32□□□□□ -1.88
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ECHDC1-211ENST00000460558 CHID1Q9BWS9 393 aa3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 NUF2Q9BZD4 464 aa3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 OR51B5Q9H339 312 aa3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 DPAGT1Q9H3H5 408 aa3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa3.32□□□□□ -1.88
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ECHDC1-211ENST00000460558 FLRT3Q9NZU0 649 aa3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC17A7Q9P2U7 560 aa3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 FOXJ3Q9UPW0 622 aa3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 CCL27Q9Y4X3 112 aa3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 ASB4Q9Y574 426 aa3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 CEPT1Q9Y6K0 416 aa3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 USH1CQ9Y6N9 552 aa3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa3.32□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 STARD9Q9P2P6 4700 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 A0A0A6YYD5 115 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 A0A1W2PPW3 197 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 GAGE12JA6NER3 117 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 ANKRD61A6NGH8 418 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 A8MXK9 166 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF195O14628 629 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 TPPPO94811 219 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 TGDSO95455 350 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 IGKV3-15P01624 115 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 IGLV1-44P01699 117 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 IGHV4-59P01825 116 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 CCDC159P0C7I6 412 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 CETN2P41208 172 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 GDF5P43026 501 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 MAGEB1P43366 347 aa3.31□□□□□ -1.88
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