RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460258.5

NOP56-204, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 4

Gene NOP56, Length 837 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-204ENST00000460258 MEGF11A6BM72 1044 aa10.16□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 CLDN24A6NM45 220 aa10.16□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 AKAP10O43572 662 aa10.16□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 PTHP01270 115 aa10.16□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 CCNOP22674 350 aa10.16□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 CCT3P49368 545 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 ETF1P62495 437 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 GUCY2DQ02846 1103 aa10.16□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 C1orf140Q5VVS0 124 aa10.16□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 TMEM53Q6P2H8 277 aa10.16□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 CCDC121Q6ZUS5 278 aa10.16□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 VMO1Q7Z5L0 202 aa10.16□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 OR56A1Q8NGH5 318 aa10.16□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 FAM76AQ8TAV0 307 aa10.16□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 SLC7A13Q8TCU3 470 aa10.16□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 SLC25A36Q96CQ1 311 aa10.16□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 LRR1Q96L50 414 aa10.16□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 SSX3Q99909 188 aa10.16□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 MECRQ9BV79 373 aa10.16□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 ULBP2Q9BZM5 246 aa10.16□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 IL19Q9UHD0 177 aa10.16□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 TMCO1Q9UM00 188 aa10.16□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 KMT2AQ03164 3969 aa10.16□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa10.15□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 A8MVM7 634 aa10.15□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 NPIPB8E9PQR5 432 aa10.15□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 IFNL4K9M1U5 179 aa10.15□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 NPFFO15130 113 aa10.15□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 CHST1O43916 411 aa10.15□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 SMIM24O75264 130 aa10.15□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 TFPTP0C1Z6 253 aa10.15□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 SSTR1P30872 391 aa10.15□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 HSD17B3P37058 310 aa10.15□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 NPY4RP50391 375 aa10.15□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 KCNJ10P78508 379 aa10.15□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 XKR7Q5GH72 579 aa10.15□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 FAM201AQ5SY85 155 aa10.15□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 DCDC5Q6ZRR9 648 aa10.15□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 CCDC91Q7Z6B0 441 aa10.15□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 HMGN2P46Q86SG4 172 aa10.15□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 CTAGE3PQ8IX95 158 aa10.15□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 Q8N2B8 174 aa10.15□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 MIER2Q8N344 545 aa10.15□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 SLC22A24Q8N4F4 322 aa10.15□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 MAGEB18Q96M61 343 aa10.15□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 OR2V2Q96R30 315 aa10.15□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 SH3GL3Q99963 347 aa10.15□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 EMC6Q9BV81 110 aa10.15□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa10.15□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 ZNF350Q9GZX5 532 aa10.15□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 REEP4Q9H6H4 257 aa10.15□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 GUCA1BQ9UMX6 200 aa10.15□□□□□ -0.78
NOP56-204ENST00000460258 MEIOCA2RUB1 952 aa10.14□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 FAM159BA6NKW6 160 aa10.14□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 FTCDNL1E5RQL4 147 aa10.14□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 FBP2O00757 339 aa10.14□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 SURF4O15260 269 aa10.14□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 TBX19O60806 448 aa10.14□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 AK1P00568 194 aa10.14□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 APLNRP35414 380 aa10.14□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 PSMB10P40306 273 aa10.14□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 WNT5AP41221 380 aa10.14□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 VEGFCP49767 419 aa10.14□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 CLCQ05315 142 aa10.14□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 SMU1Q2TAY7 513 aa10.14□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 BEND2Q8NDZ0 799 aa10.14□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 OR5AU1Q8NGC0 362 aa10.14□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 OR6N1Q8NGY5 312 aa10.14□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 FAM234AQ9H0X4 552 aa10.14□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 TBK1Q9UHD2 729 aa10.14□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 CHST2Q9Y4C5 530 aa10.14□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 TIMM22Q9Y584 194 aa10.14□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 A0A1B0GVI7 797 aa10.13□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa10.13□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa10.13□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 SLC25A17O43808 307 aa10.13□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 FSTL3O95633 263 aa10.13□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 QDPRP09417 244 aa10.13□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 MAPK1P28482 360 aa10.13□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 SAA4P35542 130 aa10.13□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 FOXA1P55317 472 aa10.13□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 RPS26P62854 115 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 GUCA2AQ02747 115 aa10.13□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 PLP2Q04941 152 aa10.13□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 IMPG1Q17R60 797 aa10.13□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 SPDYE7PQ495Y7 208 aa10.13□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 Q6ZR03 302 aa10.13□□□□□ -0.79
NOP56-204ENST00000460258 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.5 ms