RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 C9orf170A2RU37 121 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 M0QZ24 198 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 ADAMTS3O15072 1205 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 LCATP04180 440 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 SLC6A1P30531 599 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 ARL4DP49703 201 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 DCAF7P61962 342 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 CACNG1Q06432 222 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 PLCXD2Q0VAA5 305 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 CAPSQ13938 189 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 C5orf47Q569G3 176 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 OR4F3Q6IEY1 312 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF620Q6ZNG0 422 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 ZFAND4Q86XD8 727 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 WDFY1Q8IWB7 410 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 OR4D9Q8NGE8 314 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM125Q96AQ2 219 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 MRGPRX1Q96LB2 322 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 DIRC2Q96SL1 478 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 CISHQ9NSE2 258 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 FOXJ3Q9UPW0 622 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 DVL2O14641 736 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 DSCR3O14972 297 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 OGG1O15527 345 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 CA11O75493 328 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 EEDO75530 441 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 TXNP10599 105 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 GOT1P17174 413 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 HLA-GP17693 338 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 MAS1LP35410 378 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 SRP14P37108 136 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 DGKEP52429 567 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 UFM1P61960 85 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 IRF9Q00978 393 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 GPM6BQ13491 265 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 DOC2BQ14184 412 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 FAM78BQ5VT40 261 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 OPN5Q6U736 354 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 CHST9Q7L1S5 443 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF687Q8N1G0 1237 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 DTWD1Q8N5C7 304 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 C16orf70Q9BSU1 422 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 SELENOIQ9C0D9 397 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 HSPB8Q9UJY1 196 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 DIRC3C9JPN6 131 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 SLC31A1O15431 190 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 MPGP29372 298 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 IL13P35225 146 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 NPY4RP50391 375 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 TAS2R20P59543 309 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 CTBP1Q13363 440 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 NPY5RQ15761 445 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 ADIPOQQ15848 244 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 FAAP20Q6NZ36 180 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF790Q6PG37 636 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 ABHD15Q6UXT9 468 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 ZPBP2Q6X784 338 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 GATSQ8NAP1 163 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 OR10P1Q8NGE3 313 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 EDARADDQ8WWZ3 215 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 WNT2BQ93097 391 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM45BQ96B21 275 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 SLCO4A1Q96BD0 722 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 ACY3Q96HD9 319 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 SGK494Q96LW2 274 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 SORT1Q99523 831 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 WDR18Q9BV38 432 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 THSD1Q9NS62 852 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 PIGVQ9NUD9 493 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 ASB6Q9NWX5 421 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 P4HTMQ9NXG6 502 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 SEMA5BQ9P283 1151 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 SLC7A7Q9UM01 511 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 AMDHD2Q9Y303 409 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 UFC1Q9Y3C8 167 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 MEIS3P1A6NDR6 274 aa5.14□□□□□ -1.59
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