RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441439.6

LMO3-208, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,515 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-208ENST00000441439 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 RNF126Q9BV68 326 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 KCNE5Q9UJ90 142 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 STARD10Q9Y365 291 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 PRR32B1ATL7 298 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 HOXB5P09067 269 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 HOXA5P20719 270 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 NFYBP25208 207 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 GLP1RP43220 463 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 PRKAG1P54619 331 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 CLDN12P56749 244 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 PLA2G7Q13093 441 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 ELOCQ15369 112 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 RHEBQ15382 184 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 OR10K2Q6IF99 312 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 RTL10Q7L3V2 364 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 HMGN2P46Q86SG4 172 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 ADIPOR2Q86V24 386 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 OR5AR1Q8NGP9 310 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 MRGPRFQ96AM1 343 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 ARMC5Q96C12 935 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 PHB2Q99623 299 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 SCRT1Q9BWW7 348 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 UFSP2Q9NUQ7 469 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 IL36AQ9UHA7 158 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 OR10H1Q9Y4A9 318 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 SCN2AQ99250 2005 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 OR2W5A6NFC9 320 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 ZNF208O43345 1280 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 LILRB3O75022 631 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 LEFTY1O75610 366 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 CKMP06732 381 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 LINC00271P0C7V0 271 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 OR1D2P34982 312 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 CENPAP49450 140 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 TAS2R31P59538 309 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 RAB1AP62820 205 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 KCNAB1Q14722 419 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 ZNF124Q15973 351 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 ZNF750Q32MQ0 723 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 Q6ZVU0 165 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 LYPD6Q86Y78 171 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 OR52E2Q8NGJ4 325 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 OR9A2Q8NGT5 310 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 SLC41A2Q96JW4 573 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 IL17FQ96PD4 163 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 GGACTQ9BVM4 153 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 VSIG4Q9Y279 399 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 TRAV27A0A087WT01 109 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 OR1F1O43749 312 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 ELFN1P0C7U0 828 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 RAB5AP20339 215 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 ACKR3P25106 362 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 GSK3AP49840 483 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 F2RL1P55085 397 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 IL15RAQ13261 267 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 RAB33AQ14088 237 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 ZNF234Q14588 700 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 METRNLQ641Q3 311 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 PRSS54Q6PEW0 395 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 HIST2H3AQ71DI3 136 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 TMPRSS12Q86WS5 348 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 NPAS4Q8IUM7 802 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 ZFP82Q8N141 532 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 ARL14Q8N4G2 192 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 MFSD9Q8NBP5 474 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 SLC16A11Q8NCK7 471 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 OR7G2Q8NG99 324 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 PAQR8Q8TEZ7 354 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 LCN9Q8WX39 176 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 AQP3Q92482 292 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 VN1R3Q9BXE9 311 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 TRIM2Q9C040 744 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 SMDT1Q9H4I9 107 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 TRPV4Q9HBA0 871 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 TREM1Q9NP99 234 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 TCFL5Q9UL49 500 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms