RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429798.1

LIMD1-AS1-202, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LIMD1-AS1, Length 955 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GUSBP1Q15486 140 aa9.07□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 STK11Q15831 433 aa9.07□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OCLNQ16625 522 aa9.07□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C4orf17Q53FE4 359 aa9.07□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC25A30Q5SVS4 291 aa9.07□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FBXW9Q5XUX1 488 aa9.07□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 VWA1Q6PCB0 445 aa9.07□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TFAP2EQ6VUC0 442 aa9.07□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BEND4Q6ZU67 534 aa9.07□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SEM1Q6ZVN7 128 aa9.07□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GLB1L2Q8IW92 636 aa9.07□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR10H5Q8NGA6 315 aa9.07□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RHOXF1Q8NHV9 184 aa9.07□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CNIH3Q8TBE1 160 aa9.07□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ASB5Q8WWX0 329 aa9.07□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MCHR2Q969V1 340 aa9.07□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DMRTA2Q96SC8 542 aa9.07□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NUAK2Q9H093 628 aa9.07□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KCNN2Q9H2S1 579 aa9.07□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MED20Q9H944 212 aa9.07□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CRLF2Q9HC73 371 aa9.07□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF226Q9NYT6 803 aa9.07□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MALT1Q9UDY8 824 aa9.07□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SHANK1Q9Y566 2161 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A0A0G2JNJ9 132 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MSTNO14793 375 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LRRTM2O43300 516 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DHHO43323 396 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM20BO75063 409 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMCC2O75069 709 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ENTPD6O75354 484 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 UPK3AO75631 287 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TNFSF13O75888 250 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TOXO94900 526 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GLCEO94923 617 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGHV3-9P01782 118 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GYPBP06028 91 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CTLA4P16410 223 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF823P16415 610 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NPR2P20594 1047 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MPGP29372 298 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CHRNB4P30926 498 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HTR1FP30939 366 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ISL1P61371 349 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FMODQ06828 376 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAPQ12884 760 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FOXF2Q12947 444 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGFBP7Q16270 282 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HIST3H3Q16695 136 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C10orf128Q5T292 105 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TSPO2Q5TGU0 170 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KLHL24Q6TFL4 600 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NHLRC1Q6VVB1 395 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 Q6ZT83 130 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BTLAQ7Z6A9 289 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MRGPRGQ86SM5 289 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZBTB46Q86UZ6 589 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZGRF1Q86YA3 2104 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF786Q8N393 782 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MARVELD2Q8N4S9 558 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SEC61A2Q9H9S3 476 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GPR35Q9HC97 309 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC7A10Q9NS82 523 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TAS2R16Q9NYV7 291 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 Q9UFV3 132 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 B9D1Q9UPM9 204 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TPRKBQ9Y3C4 175 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LRRC42Q9Y546 428 aa9.06□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGSF10Q6WRI0 2623 aa9.05□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa9.05□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CIB4A0PJX0 185 aa9.05□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EFCAB10A6NFE3 127 aa9.05□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa9.05□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C1QL1O75973 258 aa9.05□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MSR1P21757 451 aa9.05□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LAP3P28838 519 aa9.05□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GSTT1P30711 240 aa9.05□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PYCR1P32322 319 aa9.05□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 UQCRFS1P47985 274 aa9.05□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MTNR1AP48039 350 aa9.05□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CDK5R2Q13319 367 aa9.05□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 P2RY6Q15077 328 aa9.05□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CEACAM16Q2WEN9 425 aa9.05□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa9.05□□□□□ -0.96
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KLHL22Q53GT1 634 aa9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms