RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 IQCF5A8MTL0 148 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 C17orf105B2RV13 164 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 H7C417 338 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 SLC22A1O15245 554 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 OR1F1O43749 312 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 NOL3O60936 208 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 PDYNP01213 254 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 CGAP01215 116 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 CATP04040 527 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 ETS2P15036 469 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 NCK1P16333 377 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 IL32P24001 234 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 SERPINB1P30740 379 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 PIK3CBP42338 1070 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 STARP49675 285 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 ARFIP1P53367 373 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 RAB8AP61006 207 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 UBA52P62987 128 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 RPL38P63173 70 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 TUBA1BP68363 451 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 SELPLGQ14242 412 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 PTGR1Q14914 329 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 SPIN4Q56A73 249 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 SPANXN4Q5MJ08 99 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 OR2T5Q6IEZ7 315 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 STAC2Q6ZMT1 411 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 TUBA1AQ71U36 451 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 PRSS48Q7RTY5 328 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 LAS2Q8IYD9 372 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 TAGAPQ8N103 731 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 CLEC4FQ8N1N0 589 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 MUC15Q8N387 334 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF740Q8NDX6 193 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 OR2T29Q8NH02 315 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 CYGBQ8WWM9 190 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 S100ZQ8WXG8 99 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 HSD17B8Q92506 261 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 FCGR1BQ92637 280 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 UBE2E3Q969T4 207 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 MUL1Q969V5 352 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 FAM162AQ96A26 154 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 PYCR2Q96C36 320 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 RADILQ96JH8 1075 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF347Q96SE7 839 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 SEPHS2Q99611 448 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 APOL4Q9BPW4 351 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 PRRG4Q9BZD6 226 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 UBQLN3Q9H347 655 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM38AQ9H6F2 299 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 NT5DC2Q9H857 520 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 PROK2Q9HC23 129 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 TBC1D23Q9NUY8 699 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 SCN3BQ9NY72 215 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 C1orf226A1L170 272 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 CLDN24A6NM45 220 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 IFITM10A6NMD0 228 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 B4DSR2 109 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 RFXANKO14593 260 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 PRYO14603 147 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 GNGT2O14610 69 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 RAMP1O60894 148 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 CLPXO76031 633 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 LY6HO94772 140 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 IFNA14P01570 189 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 PEPDP12955 493 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 ANXA8P13928 327 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 COX7A2P14406 83 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 SDC1P18827 310 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 MTPNP58546 118 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 SELENOWP63302 87 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 SLC35A2P78381 396 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 CD47Q08722 323 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 FUT7Q11130 342 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 PDE7AQ13946 482 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 FAM189A2Q15884 450 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 SGCBQ16585 318 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 RNLSQ5VYX0 342 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 TIGD3Q6B0B8 471 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 LAIR2Q6ISS4 152 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 IKBIPQ70UQ0 350 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 C17orf64Q86WR6 236 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF595Q8IYB9 648 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 UBQLNLQ8IYU4 475 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF619Q8N2I2 560 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 MFSD9Q8NBP5 474 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 NUBPLQ8TB37 319 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 SLC2A12Q8TD20 617 aa5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms