RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398741.5

PRAME-201, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-201ENST00000398741 OR2A4O95047 310 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 OR6A2O95222 327 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 PLGP00747 810 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 GTF2F2P13984 249 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 ZNF250P15622 560 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 KIR3DL2P43630 455 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 POU3F4P49335 361 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 DLX5P56178 289 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 RAB11BQ15907 218 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 MEP1BQ16820 701 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 NHLRC1Q6VVB1 395 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 MCHR2Q969V1 340 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 SLC25A36Q96CQ1 311 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 ZNF285Q96NJ3 590 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 OR2A7Q96R45 310 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 AMELYQ99218 206 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 KLHDC3Q9BQ90 382 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 GPR27Q9NS67 375 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 RDH8Q9NYR8 311 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 SPEF1Q9Y4P9 236 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 OR2M5A3KFT3 312 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 SCO1O75880 301 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 FBXO45P0C2W1 286 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 GABRA4P48169 554 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 EFNB2P52799 333 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 GFERP55789 205 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 DMWDQ09019 674 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 WDR45BQ5MNZ6 344 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 SLC35D2Q76EJ3 337 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 ASB17Q8WXJ9 295 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 FOXN4Q96NZ1 517 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 OR8B4Q96RC9 309 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 KIF25Q9UIL4 384 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 C10orf142B7Z368 130 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 BGLAPP02818 100 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 SPARCP09486 303 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 AKAIN1P0CW23 69 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 VSIG10L2P0DP72 767 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 PRSS3P35030 304 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 FASLGP48023 281 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 GUCA2AQ02747 115 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 KCNAB1Q14722 419 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 SLC17A1Q14916 467 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 ELOCQ15369 112 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 OTPQ5XKR4 325 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 SLC18B1Q6NT16 456 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 TTLL10Q6ZVT0 673 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 KRT77Q7Z794 578 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 TSLPQ969D9 159 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 FAM3DQ96BQ1 224 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 LANCL2Q9NS86 450 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 B9D1Q9UPM9 204 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 DHDHQ9UQ10 334 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 MMACHCQ9Y4U1 282 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-201ENST00000398741 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-201ENST00000398741 A0A1W2PPC4 97 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-201ENST00000398741 CDC14CA4D256 554 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-201ENST00000398741 MEIS3P1A6NDR6 274 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-201ENST00000398741 MCRIP1C9JLW8 97 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-201ENST00000398741 RAD1O60671 282 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-201ENST00000398741 GP1BBP13224 206 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-201ENST00000398741 PGCP20142 388 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-201ENST00000398741 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
PRAME-201ENST00000398741 COL19A1Q14993 1142 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-201ENST00000398741 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
PRAME-201ENST00000398741 C2orf76Q3KRA6 126 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-201ENST00000398741 MARCH3Q86UD3 253 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-201ENST00000398741 ZNF679Q8IYX0 411 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-201ENST00000398741 SLC38A6Q8IZM9 456 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-201ENST00000398741 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
PRAME-201ENST00000398741 OR5M1Q8NGP8 315 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-201ENST00000398741 OR6N1Q8NGY5 312 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-201ENST00000398741 LMX1AQ8TE12 382 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-201ENST00000398741 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-201ENST00000398741 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
PRAME-201ENST00000398741 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
PRAME-201ENST00000398741 OR1F2PQ96R84 312 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-201ENST00000398741 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-201ENST00000398741 TMEM138Q9NPI0 162 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-201ENST00000398741 CKLFQ9UBR5 152 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-201ENST00000398741 HEATR5AQ86XA9 2040 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-201ENST00000398741 PRSS37A4D1T9 235 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-201ENST00000398741 TLCD2A6NGC4 264 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-201ENST00000398741 LILRA5A6NI73 299 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-201ENST00000398741 F5H5P2 479 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-201ENST00000398741 SLC17A2O00624 439 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-201ENST00000398741 GOSR2O14653 212 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-201ENST00000398741 ARPC5O15511 151 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-201ENST00000398741 SLC16A7O60669 478 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-201ENST00000398741 RP2O75695 350 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-201ENST00000398741 SIX6O95475 246 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-201ENST00000398741 FCER2P06734 321 aa11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms