RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397611.7

PTPRD-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 8,242 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-205ENST00000397611 TMEM72A0PK05 275 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-205ENST00000397611 CSTBP04080 98 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
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PTPRD-205ENST00000397611 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-205ENST00000397611 RPL19P84098 196 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
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PTPRD-205ENST00000397611 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
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PTPRD-205ENST00000397611 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRD-205ENST00000397611 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-205ENST00000397611 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-205ENST00000397611 SCN8AQ9UQD0 1980 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-205ENST00000397611 NPIPB13A6NJU9 1138 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-205ENST00000397611 NPIPB4C9JG80 1138 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-205ENST00000397611 CLDN4O14493 209 aa4.98□□□□□ -1.61
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