RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 SRFP11831 508 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 OPCMLQ14982 345 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 ANGPTL5Q86XS5 388 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 RDH10Q8IZV5 341 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 APH1AQ96BI3 265 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 A0A0U1RQK1 487 aa18.58■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 RAF1P04049 648 aa18.58■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 ACHEP22303 614 aa18.58■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF674Q2M3X9 581 aa18.58■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 H7C1Q1 480 aa18.58■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 MED6O75586 246 aa18.58■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 GLULP15104 373 aa18.58■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 BSGP35613 385 aa18.58■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 EMC4Q5J8M3 183 aa18.58■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa18.58■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa18.58■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa18.58■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 KCNAB1Q14722 419 aa18.58■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 LTC4SQ16873 150 aa18.58■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 TCTN3Q6NUS6 607 aa18.58■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 EGFL6Q8IUX8 553 aa18.58■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 BCORP1Q8N888 145 aa18.58■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 DMBX1Q8NFW5 382 aa18.58■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 PIGTQ969N2 578 aa18.58■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa18.58■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1W2PPC4 97 aa18.58■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 CAPZBP47756 277 aa18.58■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 ACSM5Q6NUN0 579 aa18.58■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 SH2D5Q6ZV89 423 aa18.58■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa18.58■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 CDCA4Q9BXL8 241 aa18.58■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 COPS3Q9UNS2 423 aa18.58■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 A0A087WV62 115 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 HSPB6O14558 160 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 PPP2CBP62714 309 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 PPP2CAP67775 309 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 GABARAPL3Q9BY60 117 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 CHST11Q9NPF2 352 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 NTNG1Q9Y2I2 539 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 ZAR1LA6NP61 321 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 SSX4O60224 188 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 FADS1O60427 444 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 HBG1P69891 147 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 HBG2P69892 147 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 HSF1Q00613 529 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 OVCH1Q7RTY7 1134 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 OR2A1Q8NGT9 310 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 DUSP21Q9H596 190 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 SERTAD4Q9NUC0 356 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 AKAP11Q9UKA4 1901 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 FABP7O15540 132 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 SGCEO43556 437 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 TPOP07202 933 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 HTD2P86397 168 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 VWA2Q5GFL6 755 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 CCL4L1Q8NHW4 92 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 MAST2Q6P0Q8 1798 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 FXYD1O00168 92 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 ECI1P42126 302 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM81Q6P7N7 255 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 NAXDQ8IW45 347 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 SDHAP31040 664 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 DOK3Q7L591 496 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 EMC6Q9BV81 110 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 OR6C76A6NM76 312 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 SLC2A1P11166 492 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 CCR2P41597 374 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 CCL11P51671 97 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 FAM53BQ14153 422 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 FCN2Q15485 313 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM196Q5HYL7 178 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 ALKAL2Q6UX46 152 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 SLC25A46Q96AG3 418 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 LAT2Q9GZY6 243 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 PMS2P2O95744 297 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 CEACAM5P06731 702 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 LYSMD2Q8IV50 215 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 MORN4Q8NDC4 146 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 ZADH2Q8N4Q0 377 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 DCBLD2Q96PD2 775 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 FKRPQ9H9S5 495 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 DIO1P49895 249 aa18.55■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 ETV1P50549 477 aa18.55■□□□□ 0.56
CCSAP-203ENST00000366687 PMPCAQ10713 525 aa18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms