RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359276.8

CTPS2-201, Transcript of CTP synthase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTPS2, Length 3,629 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2-201ENST00000359276 TNFSF18Q9UNG2 199 aa15□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 SLC22A7Q9Y694 548 aa15□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 F5P12259 2224 aa15□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 TRPM7Q96QT4 1865 aa15□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 TRPM6Q9BX84 2022 aa14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 SLC35G6P0C7Q6 338 aa14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 S100PP25815 95 aa14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 CTXN1P60606 82 aa14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 DUSP8Q13202 625 aa14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 IRF4Q15306 451 aa14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 GLYATL3Q5SZD4 288 aa14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 OR2L13Q8N349 312 aa14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 LCN9Q8WX39 176 aa14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 AKR1E2Q96JD6 320 aa14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 AICDAQ9GZX7 198 aa14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 I3L1I5 382 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 ST6GAL1P15907 406 aa14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 PTAFRP25105 342 aa14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 CTGFP29279 349 aa14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 CMPK1P30085 196 aa14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 SLC9A3R2Q15599 337 aa14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 NCMAPQ5T1S8 102 aa14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 ANKRD10Q9NXR5 420 aa14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 S100A8P05109 93 aa14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 DNASE1L1P49184 302 aa14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 RAB2AP61019 212 aa14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 IRF5Q13568 498 aa14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 MPPED2Q15777 294 aa14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 SLC29A4Q7RTT9 530 aa14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 ZAR1Q86SH2 424 aa14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 LURAP1LQ8IV03 231 aa14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 OR5M8Q8NGP6 311 aa14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 RGCCQ9H4X1 137 aa14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 EPHX3Q9H6B9 360 aa14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 PRR13Q9NZ81 148 aa14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 DPP7Q9UHL4 492 aa14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 VEGFDO43915 354 aa14.98□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 LILRB5O75023 590 aa14.98□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 HTR3BO95264 441 aa14.98□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 SFTPBP07988 381 aa14.98□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 PI3P19957 117 aa14.98□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 PPP1R1AQ13522 171 aa14.98□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 ARHGAP19Q14CB8 494 aa14.98□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 EBPQ15125 230 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 LY6G6FQ5SQ64 297 aa14.98□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 OR52W1Q6IF63 320 aa14.98□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 C17orf99Q6UX52 265 aa14.98□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 TTLL10Q6ZVT0 673 aa14.98□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 PPP1R14AQ96A00 147 aa14.98□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 ARRDC3Q96B67 414 aa14.98□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 FRRS1LQ9P0K9 344 aa14.98□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 GPR34Q9UPC5 381 aa14.98□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 SLC22A13Q9Y226 551 aa14.98□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 C11orf98E9PRG8 122 aa14.98□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 YKT6O15498 198 aa14.98□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 ZNF749O43361 778 aa14.98□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 SFTA3P0C7M3 94 aa14.98□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 ABCD3P28288 659 aa14.98□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 GNALP38405 381 aa14.98□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 BIKQ13323 160 aa14.98□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 MRI1Q9BV20 369 aa14.98□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 PLXNA3P51805 1871 aa14.98□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 NME1P15531 152 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 DEFA6Q01524 100 aa14.98□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa14.98□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 OR52E1Q8NGJ3 308 aa14.98□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 PHYHIPQ92561 330 aa14.98□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 VOPP1Q96AW1 172 aa14.98□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 CMTM3Q96MX0 182 aa14.98□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 SFXN1Q9H9B4 322 aa14.98□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa14.97□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 TGM5O43548 720 aa14.97□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 B3GALT2O43825 422 aa14.97□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 SERPINF1P36955 418 aa14.97□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 PNLIPRP2P54317 469 aa14.97□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 ZNF616Q08AN1 781 aa14.97□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 ANKRD16Q6P6B7 361 aa14.97□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 LMLNQ96KR4 655 aa14.97□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 SPACA6W5XKT8 324 aa14.97□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa14.97□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 A0A1W2PR64 198 aa14.97□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 A0A1W2PRV1 198 aa14.97□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 DNAJB6O75190 326 aa14.97□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 PLGP00747 810 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 SLC2A5P22732 501 aa14.97□□□□□ -0.01
CTPS2-201ENST00000359276 SLC7A9P82251 487 aa14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms