RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 PRAMEF25A6NGN4 478 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 AGAP14A8MT82 685 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 RNF224P0DH78 156 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 SRP14P37108 136 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 TPMTP51580 245 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 RAC1P63000 192 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 SLC7A9P82251 487 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 GALEQ14376 348 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 BARHL1Q9BZE3 327 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 A0A1W2PR80 420 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 STMND1H3BQB6 276 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 SPRY3O43610 288 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 GPX3P22352 226 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 HTR2CP28335 458 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 PIGAP37287 484 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 UCN3Q969E3 161 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 APH1AQ96BI3 265 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 SLC29A1Q99808 456 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 BLACEA4D250 179 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 CCSMST1Q4G0I0 132 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 ZNF691Q5VV52 312 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 ASB17Q8WXJ9 295 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 RABL2BQ9UNT1 228 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 PIAS2O75928 621 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 IAPPP10997 89 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 NTF3P20783 257 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 IRS1P35568 1242 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 SSX7Q7RTT5 188 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 DPPA2Q7Z7J5 298 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 OR1E3Q8WZA6 343 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 SHISA4Q96DD7 197 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 B3GAT1Q9P2W7 334 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 GAB2Q9UQC2 676 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 A0A1B0GTW7 788 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 HCRTR1O43613 425 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 DTYMKP23919 212 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 GNG10P50151 68 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 KCNJ8Q15842 424 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 FAM69AQ5T7M9 428 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 ANGPTL5Q86XS5 388 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 CPXM2Q8N436 756 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 ZIC5Q96T25 663 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 VRTNQ9H8Y1 702 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 SIX6O95475 246 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 GLRA1P23415 457 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 MOB3BQ86TA1 216 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 OR4Q3Q8NH05 313 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 GHSRQ92847 366 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 C1GALT1Q9NS00 363 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 SCN11AQ9UI33 1791 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 MEIOCA2RUB1 952 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 TMEM202A6NGA9 273 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 B3GALNT1O75752 331 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 TP53P04637 393 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 DHRS4L1P0CG22 281 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 HBG1P69891 147 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 HBG2P69892 147 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 PARP16Q8N5Y8 322 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 NUDT8Q8WV74 236 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 ZFPM2Q8WW38 1151 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 CTSFQ9UBX1 484 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 NDRG3Q9UGV2 375 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 OR2W5A6NFC9 320 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 KCNK5O95279 499 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 ADRA1AP35348 466 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 OPRD1P41143 372 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 MEP1BQ16820 701 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 TATDN3Q17R31 274 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 SPANXN5Q5MJ07 72 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 RANBP10Q6VN20 620 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 PLPP5Q8NEB5 264 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 SLC37A2Q8TED4 501 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 C11orf40Q8WZ69 217 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 TMEM106AQ96A25 262 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 GPR78Q96P69 363 aa9.72□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 FBXO4Q9UKT5 387 aa9.72□□□□□ -0.85
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