RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328514.11

GINS3-202, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-202ENST00000328514 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa10.21□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa10.21□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 F5H0A9 414 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 PSMD9O00233 223 aa10.21□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 B3GALT2O43825 422 aa10.21□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP10.21□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 FGF18O76093 207 aa10.21□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 RPP14O95059 124 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 TXNDC12O95881 172 aa10.21□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 TM4SF4P48230 202 aa10.21□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 KCNJ3P48549 501 aa10.21□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 EMDP50402 254 aa10.21□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 PNLIPRP2P54317 469 aa10.21□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 ATP1B3P54709 279 aa10.21□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 TAF13Q15543 124 aa10.21□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 RAB12Q6IQ22 244 aa10.21□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 TMEM71Q6P5X7 295 aa10.21□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 KIRREL2Q6UWL6 708 aa10.21□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 ABHD13Q7L211 337 aa10.21□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 LYG2Q86SG7 212 aa10.21□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 OR13C8Q8NGS7 320 aa10.21□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 OR8S1Q8NH09 359 aa10.21□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 NXPE3Q969Y0 559 aa10.21□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 ZBTB8AQ96BR9 441 aa10.21□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 RASD2Q96D21 266 aa10.21□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 ZNF251Q9BRH9 671 aa10.21□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
GINS3-202ENST00000328514 A0A1B0GVT2 93 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 A0A1W2PPC1 479 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 LRRC72A6NJI9 287 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 OR2AT4A6NND4 320 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 EFCAB7A8K855 629 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 PRRT4C9JH25 899 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 NPIPB9F8W1W9 429 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 KAT7O95251 611 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 AMY2AP04746 511 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 SLC35G6P0C7Q6 338 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 ADH5P11766 374 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 TPT1P13693 172 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 CEBPBP17676 345 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 TACR3P29371 465 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 PPM1AP35813 382 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 PPICP45877 212 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 PRKXP51817 358 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 ECH1Q13011 328 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 MEF2DQ14814 521 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 ZNF141Q15928 474 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 FCRL6Q6DN72 434 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 LEG1Q6P5S2 330 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 TMED4Q7Z7H5 227 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 PARGQ86W56 976 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 C12orf40Q86WS4 652 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 GALNT16Q8N428 558 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 ZNF676Q8N7Q3 588 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 ZDHHC22Q8N966 263 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 ZNF511Q8NB15 262 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 OR4A4PQ8NGN8 299 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 CD99L2Q8TCZ2 262 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 RXFP4Q8TDU9 374 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 C4orf45Q96LM5 186 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 DCBLD2Q96PD2 775 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 LMAN2LQ9H0V9 348 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 UQCC1Q9NVA1 299 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 HIF3AQ9Y2N7 669 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 OR10H1Q9Y4A9 318 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 URADA6NGE7 173 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 IGLON5A6NGN9 336 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 OR6C76A6NM76 312 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 PHYHO14832 338 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 FADS1O60427 444 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 GPR75O95800 540 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 CYB5AP00167 134 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 ADH1AP07327 375 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 FAM157CP0CG43 387 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 ALOX5APP20292 161 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 GRPRP30550 384 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 NPBWR1P48145 328 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 CAPZA1P52907 286 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 PJVKQ0ZLH3 352 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 PDZK1IP1Q13113 114 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 ZNF234Q14588 700 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 NKAPLQ5M9Q1 402 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 PHF19Q5T6S3 580 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 ARHGAP40Q5TG30 622 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 BAP18Q8IXM2 172 aa10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms