RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 ASB10Q8WXI3 467 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 TM9SF4Q92544 642 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 KLHL15Q96M94 604 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 INTS14Q96SY0 518 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 OR2B2Q9GZK3 357 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 LAMP5Q9UJQ1 280 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 MYO15AQ9UKN7 3530 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM186AA6NE01 2351 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 F8W735 103 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 DCTN6O00399 190 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 SELENOFO60613 162 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 TMCC2O75069 709 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 GPX5O75715 221 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 CLPXO76031 633 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHG1P01857 330 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 RFPL3SP0C7P2 107 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 GALP22466 123 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 HCCSP53701 268 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 BIDP55957 195 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 OR12D2P58182 307 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 SIRPAP78324 504 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 H3F3AP84243 136 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 NHLH1Q02575 133 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF85Q03923 595 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 Q6ZS46 218 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 MS4A15Q8N5U1 240 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 SYT14Q8NB59 555 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM178AQ8NBL3 297 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 OR6X1Q8NH79 312 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 NDNFQ8TB73 568 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNRF4Q8WWF5 429 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 ASB17Q8WXJ9 295 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM203Q969S6 136 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 TXNDC15Q96J42 360 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 C4orf36Q96KX1 117 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 KCTD7Q96MP8 289 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 CENPOQ9BU64 300 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 WDR76Q9H967 626 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 MARCH7Q9H992 704 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 QPCTLQ9NXS2 382 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 KLHL9Q9P2J3 617 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 DMDP11532 3685 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A0G2JMM0 328 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A0J9YW62 118 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1W2PPB8 328 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1W2PRS3 328 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 VGLL3A8MV65 326 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 KIR3DP1A8MWS1 328 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 NPIPA2E9PIF3 369 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 NPIPA3F8WFD2 350 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 PLPP2O43688 288 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 NME2P1O60361 137 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 SULT1C4O75897 302 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 TFP02787 698 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 KRT8P05787 483 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 HPNP05981 417 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF823P16415 610 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 NME2P22392 152 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 SHC1P29353 583 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 P2RY4P51582 365 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 CLRN1P58418 232 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 B3GALT5-AS1P59052 145 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 EGR3Q06889 387 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 MELKQ14680 651 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC10A1Q14973 349 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 MOGQ16653 247 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 CDONQ4KMG0 1287 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 HBMQ6B0K9 141 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 ASB18Q6ZVZ8 466 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 DPY19L4Q7Z388 723 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM220AQ7Z4H9 259 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC22A16Q86VW1 577 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 TIGD4Q8IY51 512 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 MDS2Q8NDY4 140 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 TIMP4Q99727 224 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 CDADC1Q9BWV3 514 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNN2Q9H2S1 579 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 MMP27Q9H306 513 aa9.02□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms