RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311626.8

HOXB3-201, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 2,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-201ENST00000311626 BGLAPP02818 100 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 IL12BP29460 328 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 POU3F4P49335 361 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 OR5M1Q8NGP8 315 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 METTL21AQ8WXB1 218 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 MED30Q96HR3 178 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 IFNA7P01567 189 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 PDGFAP04085 211 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
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HOXB3-201ENST00000311626 SFRP5Q5T4F7 317 aa22.88■■□□□ 1.25
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HOXB3-201ENST00000311626 XKRYO14609 159 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 PRAF2O60831 178 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 RBBP9O75884 186 aa22.87■■□□□ 1.25
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HOXB3-201ENST00000311626 ASPHD2Q6ICH7 369 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF285Q96NJ3 590 aa22.87■■□□□ 1.25
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HOXB3-201ENST00000311626 MESP1Q9BRJ9 268 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 RNF215Q9Y6U7 377 aa22.87■■□□□ 1.25
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HOXB3-201ENST00000311626 C2orf76Q3KRA6 126 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 SLC38A6Q8IZM9 456 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa22.86■■□□□ 1.25
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HOXB3-201ENST00000311626 CHST6Q9GZX3 395 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 LAT2Q9GZY6 243 aa22.86■■□□□ 1.25
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HOXB3-201ENST00000311626 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 TMEM212A6NML5 194 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 XRCC3O43542 346 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 OR6A2O95222 327 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 IFNGR1P15260 489 aa22.86■■□□□ 1.25
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HOXB3-201ENST00000311626 FAM198BQ6UWH4 519 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 CDH24Q86UP0 819 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF417Q8TAU3 575 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 MSANTD3Q96H12 275 aa22.86■■□□□ 1.25
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HOXB3-201ENST00000311626 ABCA7Q8IZY2 2146 aa22.86■■□□□ 1.25
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HOXB3-201ENST00000311626 TEX46H3BTG2 121 aa22.85■■□□□ 1.25
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HOXB3-201ENST00000311626 ZNF626Q68DY1 528 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 OR51S1Q8NGJ8 323 aa22.85■■□□□ 1.25
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HOXB3-201ENST00000311626 GGT3PA6NGU5 568 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 FRG2CA6NGY1 282 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 SLC25A12O75746 678 aa22.85■■□□□ 1.25
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HOXB3-201ENST00000311626 GTF2F2P13984 249 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 NSDHLQ15738 373 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 TMEM205Q6UW68 189 aa22.85■■□□□ 1.25
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HOXB3-201ENST00000311626 H0YIG0 161 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 OR1D5P58170 312 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 SLC17A1Q14916 467 aa22.84■■□□□ 1.25
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HOXB3-201ENST00000311626 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
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HOXB3-201ENST00000311626 EGR3Q06889 387 aa22.84■■□□□ 1.25
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HOXB3-201ENST00000311626 EMC4Q5J8M3 183 aa22.84■■□□□ 1.25
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HOXB3-201ENST00000311626 NDUFAF7Q7L592 441 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 LRRC20Q8TCA0 184 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 ATG5Q9H1Y0 275 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF224Q9NZL3 707 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 TLCD2A6NGC4 264 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 H7C417 338 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 L7N2F9 121 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 SUSD5O60279 629 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 CD3DP04234 171 aa22.83■■□□□ 1.25
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