RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 SAGE1Q9NXZ1 904 aa19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1B0GX78 115 aa19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 PRAMEF25A6NGN4 478 aa19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 H7C1Q1 480 aa19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 BDH1Q02338 343 aa19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 PYCR3Q53H96 274 aa19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 RNLSQ5VYX0 342 aa19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 ANGPTL5Q86XS5 388 aa19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF225Q9UK10 706 aa19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 AGAP14A8MT82 685 aa19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 SGCEO43556 437 aa19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 GLSO94925 669 aaPredicted RBP19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 SNCAP37840 140 aa19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 THBS3P49746 956 aa19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 DUSP8Q13202 625 aa19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 FAM122BQ7Z309 247 aa19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 LGI3Q8N145 548 aa19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 SLC37A2Q8TED4 501 aa19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 GNG12Q9UBI6 72 aa19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 ASB1Q9Y576 335 aa19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 K7ESM1 405 aa19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 RACK1P63244 317 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 CST9LP1Q5W188 147 aa19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 ZFP82Q8N141 532 aa19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 YKT6O15498 198 aa19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 OIP5O43482 229 aa19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 GIPP09681 153 aaPredicted RBP19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 EMC4Q5J8M3 183 aa19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF813Q6ZN06 617 aa19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 NAXDQ8IW45 347 aa19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 DMBX1Q8NFW5 382 aa19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 ST7LQ8TDW4 575 aa19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 GSX2Q9BZM3 304 aa19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 FXYD1O00168 92 aa19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 IRS1P35568 1242 aa19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 NECAP2Q9NVZ3 263 aa19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 TMPRSS11DO60235 418 aa19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 PMP2P02689 132 aa19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 P2RX1P51575 399 aa19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF385BQ569K4 471 aa19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 OR52W1Q6IF63 320 aa19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 OR51S1Q8NGJ8 323 aa19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 CSF3RQ99062 836 aa19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM43Q9BTV4 400 aa19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 PKD1L3Q7Z443 1732 aa19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 CD1CP29017 333 aa19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 FAM122CQ6P4D5 195 aa19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 SYS1Q8N2H4 156 aa19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 OR2L13Q8N349 312 aa19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM99Q8N816 258 aa19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 SLC39A9Q9NUM3 307 aa19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 ACOXLQ9NUZ1 547 aa19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 CACNA1SQ13698 1873 aa19.4■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 SHEQ5VZ18 495 aa19.39■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 OR11L1Q8NGX0 322 aa19.39■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 DCBLD2Q96PD2 775 aa19.39■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A19Q9HC21 320 aa19.39■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 SMLR1H3BR10 107 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 ALOX12BO75342 701 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 M6PRP20645 277 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 RFX2P48378 723 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 PRSS45Q7RTY3 260 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 MARC2Q969Z3 335 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1B0GTW7 788 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 CST9Q5W186 159 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 OGFOD3Q6PK18 319 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 DYNLRB1Q9NP97 96 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHB10Q9UN67 800 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF587BE7ETH6 402 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 TPPPO94811 219 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 SOD1P00441 154 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 CD27P26842 260 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 SERPINF1P36955 418 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM200AQ86VY9 491 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 EDAQ92838 391 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 LINC01553A4QN01 128 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 LRP5LA4QPB2 252 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 DOK2O60496 412 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 SRP9P49458 86 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 DIO1P49895 249 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 FAHD1Q6P587 224 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 CYHR1Q6ZMK1 362 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 DOK3Q7L591 496 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 KDM8Q8N371 416 aa19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms