RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 OR13C2Q8NGS9 318 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 OR2Y1Q8NGV0 311 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 OR51A7Q8NH64 312 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 ABHD4Q8TB40 342 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 SNX33Q8WV41 574 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 ART5Q96L15 291 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF649Q9BS31 505 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 SLITRK2Q9H156 845 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 NIPAL2Q9H841 368 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 MED20Q9H944 212 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 DLL4Q9NR61 685 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 CYSLTR2Q9NS75 346 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 PLA2G3Q9NZ20 509 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 ICAM5Q9UMF0 924 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 PLCL2Q9UPR0 1127 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 MOKQ9UQ07 419 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 MMACHCQ9Y4U1 282 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 ATRQ13535 2644 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 TRAV27A0A087WT01 109 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A087WUJ7 227 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM183AA6NL82 134 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 HSPB2A8KAH6 182 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 NOTOA8MTQ0 251 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 NPIPA7E9PJI5 369 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 H0YIG0 161 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 ARPC3O15145 178 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 OGG1O15527 345 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNHIT1O43257 154 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 REM1O75628 298 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 SNAPC5O75971 98 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF432O94892 652 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 LALBAP00709 142 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 IGHEP01854 428 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 HIST1H2ABP04908 130 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 IFNA16P05015 189 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 CT62P0C5K7 136 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 GSTT2P0CG29 244 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 GSTT2BP0CG30 244 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 NPIPA8P0DM63 369 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 PSKH1P11801 424 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 APEHP13798 732 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 PVRP15151 417 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC2A5P22732 501 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 EDNRAP25101 427 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 APEX1P27695 318 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 KIR2DL3P43628 341 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 DIO1P49895 249 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 AP3S2P59780 193 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 DCAF7P61962 342 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 ARG2P78540 354 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 PMP22Q01453 160 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC3A1Q07837 685 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 MAB21L1Q13394 359 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 CRMP1Q14194 572 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 GGTLC2Q14390 218 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 HSPB2Q16082 182 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 PRTGQ2VWP7 1150 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 DEFB110Q30KQ9 67 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 ACSM3Q53FZ2 586 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 WBP2NLQ6ICG8 309 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 SFXN4Q6P4A7 337 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM91Q6ZNR0 172 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 OVCH1Q7RTY7 1134 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 NUP54Q7Z3B4 507 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM220AQ7Z4H9 259 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 PLCZ1Q86YW0 608 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC35F2Q8IXU6 374 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 CARFQ8N187 725 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 SAMD12Q8N8I0 201 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 OR9A4Q8NGU2 314 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 OR14A16Q8NHC5 309 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 HIST1H2ACQ93077 130 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 PTP4A1Q93096 173 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 SMIM19Q96E16 107 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 C4orf36Q96KX1 117 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 VSTM2LQ96N03 204 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 NEDD4LQ96PU5 975 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 TBX5Q99593 518 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 MESP1Q9BRJ9 268 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 MARVELD1Q9BSK0 173 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF426Q9BUY5 554 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 GON7Q9BXV9 100 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 ACTR6Q9GZN1 396 aa6.34□□□□□ -1.39
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