RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 ZNF620Q6ZNG0 422 aa19.39■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 ZNF611Q8N823 705 aa19.39■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 NABP1Q96AH0 204 aa19.39■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 MBD6Q96DN6 1003 aa19.39■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 SAMD8Q96LT4 415 aa19.39■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 SLC38A2Q96QD8 506 aa19.39■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 GRHPRQ9UBQ7 328 aa19.39■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 MGAT4BQ9UQ53 548 aa19.39■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP19.38■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa19.38■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 SLC22A23A1A5C7 686 aa19.38■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 E7EQL1 145 aa19.38■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 H7C1C5 153 aa19.38■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 TP53P04637 393 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 CECR9P0C854 216 aa19.38■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 DANCRP0C864 163 aa19.38■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 PATE4P0C8F1 98 aa19.38■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP19.38■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 SDHAP31040 664 aa19.38■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 CDAP32320 146 aa19.38■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 LCN6P62502 163 aa19.38■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 CD47Q08722 323 aa19.38■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 CCNIQ14094 377 aa19.38■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 NRN1LQ496H8 165 aa19.38■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 CCDC121Q6ZUS5 278 aa19.38■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 PTCHD4Q6ZW05 846 aa19.38■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 RADILQ96JH8 1075 aa19.38■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 SH3GL3Q99963 347 aa19.38■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 NTN4Q9HB63 628 aa19.38■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 RTTNQ86VV8 2226 aa19.38■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 VPS13CQ709C8 3753 aa19.37■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 OR8G3PP0DMU2 310 aa19.37■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 APEHP13798 732 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 DNASE1P24855 282 aa19.37■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 CALCRP30988 508 aa19.37■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 PIGFQ07326 219 aa19.37■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 KEAP1Q14145 624 aa19.37■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 ETFDHQ16134 617 aa19.37■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 PGGHGQ32M88 737 aa19.37■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 GPR139Q6DWJ6 353 aa19.37■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 C20orf204Q6ZNR8 217 aa19.37■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa19.37■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 AQP11Q8NBQ7 271 aa19.37■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 FANK1Q8TC84 345 aa19.37■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 NSMAFQ92636 917 aa19.37■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 ZNF570Q96NI8 536 aa19.37■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 RBP7Q96R05 134 aa19.37■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 DGCR6LQ9BY27 220 aa19.37■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa19.37■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 EGLN3Q9H6Z9 239 aa19.37■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 IL20Q9NYY1 176 aa19.37■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 PRSS37A4D1T9 235 aa19.36■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 ARPC3O15145 178 aa19.36■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R3DO95685 299 aa19.36■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 SCG5P05408 212 aa19.36■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 ARR3P36575 388 aa19.36■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 GK3PQ14409 553 aa19.36■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa19.36■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 OR8D4Q8NGM9 314 aa19.36■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 FNDC8Q8TC99 324 aa19.36■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa19.36■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa19.36■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 MOKQ9UQ07 419 aa19.36■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa19.35■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 EBAG9O00559 213 aa19.35■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 AHCYL1O43865 530 aa19.35■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 SOD3P08294 240 aa19.35■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 CD79AP11912 226 aa19.35■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 SLC6A6P31641 620 aa19.35■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 CAPZA2P47755 286 aa19.35■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 ZNF84P51523 738 aa19.35■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 RPS6KA3P51812 740 aa19.35■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 RAB1AP62820 205 aa19.35■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 NAAAQ02083 359 aa19.35■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 GSG1Q2KHT4 349 aa19.35■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 C1orf146Q5VVC0 180 aa19.35■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 SLC22A25Q6T423 547 aa19.35■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 CD300LDQ6UXZ3 194 aa19.35■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 ZNF584Q8IVC4 421 aa19.35■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 HS3ST5Q8IZT8 346 aa19.35■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 OR10G2Q8NGC3 310 aa19.35■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 FBXW5Q969U6 566 aa19.35■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 MS4A3Q96HJ5 214 aa19.35■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 FEVQ99581 238 aa19.35■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 NDEL1Q9GZM8 345 aa19.35■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 CXXC4Q9H2H0 198 aa19.35■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 SIAEQ9HAT2 523 aa19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms