RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638939.1

PDE4D-229, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 375 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-229ENST00000638939 TMEM19Q96HH6 336 aa4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-229ENST00000638939 PKNOX2Q96KN3 472 aa4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-229ENST00000638939 C16orf92Q96LL3 132 aa4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-229ENST00000638939 JMJD8Q96S16 334 aa4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-229ENST00000638939 ZBTB18Q99592 522 aa4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-229ENST00000638939 TMEM109Q9BVC6 243 aa4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-229ENST00000638939 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
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PDE4D-229ENST00000638939 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-229ENST00000638939 C20orf27Q9GZN8 174 aa4.71□□□□□ -1.66
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PDE4D-229ENST00000638939 G6PC2Q9NQR9 355 aa4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-229ENST00000638939 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-229ENST00000638939 SLC6A13Q9NSD5 602 aa4.71□□□□□ -1.66
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PDE4D-229ENST00000638939 SEC14L4Q9UDX3 406 aa4.71□□□□□ -1.66
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PDE4D-229ENST00000638939 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-229ENST00000638939 SH3PXD2BA1X283 911 aa4.7□□□□□ -1.66
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PDE4D-229ENST00000638939 J3QLI3 93 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-229ENST00000638939 M0R3G1 203 aa4.7□□□□□ -1.66
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PDE4D-229ENST00000638939 SEC14L2O76054 403 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-229ENST00000638939 SNAP29O95721 258 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-229ENST00000638939 RAB36O95755 333 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-229ENST00000638939 HLA-HP01893 362 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-229ENST00000638939 HPXP02790 462 aa4.7□□□□□ -1.66
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PDE4D-229ENST00000638939 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-229ENST00000638939 HTR2AP28223 471 aa4.7□□□□□ -1.66
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PDE4D-229ENST00000638939 ALDH3B1P43353 468 aa4.7□□□□□ -1.66
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PDE4D-229ENST00000638939 C1QL2Q7Z5L3 287 aa4.7□□□□□ -1.66
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PDE4D-229ENST00000638939 C3orf56Q8N813 242 aa4.7□□□□□ -1.66
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PDE4D-229ENST00000638939 FBXL7Q9UJT9 491 aa4.7□□□□□ -1.66
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PDE4D-229ENST00000638939 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-229ENST00000638939 A0A087WUJ7 227 aa4.69□□□□□ -1.66
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