RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF250P15622 560 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-217ENST00000629983 BST1Q10588 318 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-217ENST00000629983 MOGQ16653 247 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D28Q2M2D7 210 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-217ENST00000629983 KRT71Q3SY84 523 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-217ENST00000629983 PXKQ7Z7A4 578 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-217ENST00000629983 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-217ENST00000629983 GLTPQ9NZD2 209 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-217ENST00000629983 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-217ENST00000629983 TRPC5OSA6NMA1 111 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-217ENST00000629983 KITP10721 976 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-217ENST00000629983 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
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CAPNS1-217ENST00000629983 COMTD1Q86VU5 262 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-217ENST00000629983 NFKBIDQ8NI38 313 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-217ENST00000629983 ST7LQ8TDW4 575 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-217ENST00000629983 CCL17Q92583 94 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-217ENST00000629983 ELMOD3Q96FG2 381 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-217ENST00000629983 LRMDAQ9H2I8 198 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-217ENST00000629983 C1orf198Q9H425 327 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-217ENST00000629983 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNK9Q9NPC2 374 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC13A4Q9UKG4 626 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-217ENST00000629983 CLIC1O00299 241 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 ETS2P15036 469 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 OR1Q1Q15612 314 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 MIDNQ504T8 468 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 ARMCX4Q5H9R4 360 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 CEP85LQ5SZL2 805 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 NHLRC1Q6VVB1 395 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 KRT73Q86Y46 540 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 OR1J2Q8NGS2 313 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM54Q969K7 222 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 BCL2L14Q9BZR8 327 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM38BQ9NVV0 291 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 HDAC3O15379 428 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 FSHBP01225 129 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 PTHP01270 115 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 MAKP20794 623 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF81P51508 661 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 UCP2P55851 309 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 PLP2Q04941 152 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 FADDQ13158 208 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR88Q6ZMY6 472 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC35D2Q76EJ3 337 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC16A14Q7RTX9 510 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 OR4K5Q8NGD3 323 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 OR5J2Q8NH18 312 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 ZIM2Q9NZV7 527 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A0B4J2E0 115 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1B0GX12 115 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 SPRY3O43610 288 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 PRTN3P24158 256 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 VSNL1P62760 191 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 MELKQ14680 651 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC36A2Q495M3 483 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 OR1J1Q8NGS3 322 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 OR6X1Q8NH79 312 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF566Q969W8 418 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 DHHO43323 396 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 TPST1O60507 370 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 CCNOP22674 350 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 BAMBIQ13145 260 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 GCNT6Q5T4J0 391 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 OR9I1Q8NGQ6 314 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 TCF7L2Q9NQB0 619 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 SNAP29O95721 258 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 APLNRP35414 380 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 CDH12P55289 794 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 HSF2Q03933 536 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC3A1Q07837 685 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC2A7Q6PXP3 512 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 DOK3Q7L591 496 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 DPPA2Q7Z7J5 298 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 GPA33Q99795 319 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM43Q9BTV4 400 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 CENPHQ9H3R5 247 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 PLSCR5A0PG75 271 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF13O43567 381 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 FOXH1O75593 365 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 MT-ATP6P00846 226 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 BMP2P12643 396 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 GCH1P30793 250 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP4BP51164 291 aa23.21■■□□□ 1.31
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