RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 EGLN3Q9H6Z9 239 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 OSGIN1Q9UJX0 560 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 DPPA5A6NC42 116 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 SMARCD3Q6STE5 483 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC103Q8IW40 242 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 OR8D4Q8NGM9 314 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 STK35Q8TDR2 534 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM192AQ9GZU8 254 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 OR52D1Q9H346 318 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 FKBP14Q9NWM8 211 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 ANK2Q01484 3957 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 OR7A10O76100 309 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 FCGR2AP12318 317 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 CXCR1P25024 350 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 GRK5P34947 590 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 OAFQ86UD1 273 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 LNX2Q8N448 690 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 OR52L1Q8NGH7 329 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP21.29■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF524Q96C55 264 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 KLHDC3Q9BQ90 382 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 ACTR6Q9GZN1 396 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 PTGES2Q9H7Z7 377 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D23Q9NUY8 699 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 TVP23BQ9NYZ1 205 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF223E7ERA6 249 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 NPIPB7O75200 414 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 SAGP10523 405 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP6V1B1P15313 513 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 FUT1P19526 365 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 FMO3P31513 532 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 CDH15P55291 814 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 FXYD6P3P58550 94 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 FHL1Q13642 323 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 PGGHGQ32M88 737 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 ADAM5Q6NVV9 412 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 OR10D3Q8NH80 312 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 SIGLEC11Q96RL6 698 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 EMC9Q9Y3B6 208 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 SNTNA6NMZ2 147 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 A8MVM7 634 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 BHLHE40O14503 412 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 NUDT14O95848 222 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 DANCRP0C864 163 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 PIPP12273 146 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 TTKP33981 857 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 PRPS1P60891 318 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 EGR4Q05215 589 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 SNAPC1Q16533 368 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF74Q16587 644 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 CLEC12BQ2HXU8 276 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 DNM1P46Q6ZS02 220 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 PRSS48Q7RTY5 328 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 ADGRG3Q86Y34 549 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 WFDC8Q8IUA0 241 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM163Q8TC26 289 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 MYDGFQ969H8 173 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 MRGPRX4Q96LA9 322 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 SAMD8Q96LT4 415 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 OR10A4Q9H209 315 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 FN3KQ9H479 309 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 VCX3AQ9NNX9 186 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 LAMP3Q9UQV4 416 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 CADP27708 2225 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 FREM1Q5H8C1 2179 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A087WZY1 265 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 EFCAB10A6NFE3 127 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 M0R3G1 203 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF208O43345 1280 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 XPNPEP2O43895 674 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 NDUFB2O95178 105 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 MT-ATP6P00846 226 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 SOD3P08294 240 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 TSPAN19P0C672 248 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 PRKCAP17252 672 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 ADH6P28332 368 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC6A6P31641 620 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC15A1P46059 708 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 SGCBQ16585 318 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 PHC2Q8IXK0 858 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 SPARTQ8N0X7 666 aa21.26■□□□□ 0.99
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