RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612341.4

SMTN-222, Transcript of smoothelin, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SMTN, Length 3,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMTN-222	ENST00000612341	GABRA4	P48169	554 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	VEGFC	P49767	419 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	TNK1	Q13470	666 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM106A	Q96A25	262 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	KCNK15	Q9H427	330 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	LRP4	O75096	1905 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	TLCD2	A6NGC4	264 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	GPRIN2	O60269	458 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	IL33	O95760	270 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	TACSTD2	P09758	323 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	ANXA3	P12429	323 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	ADRA2C	P18825	462 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	PPIC	P45877	212 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	GSG1	Q2KHT4	349 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	LUZP2	Q86TE4	346 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	MED12	Q93074	2177 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	UPK3A	O75631	287 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	SLC25A12	O75746	678 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	CDK2	P24941	298 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	SQSTM1	Q13501	440 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	ETFDH	Q16134	617 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	TCTE1	Q5JU00	501 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	SLITRK2	Q9H156	845 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF576	Q9H609	170 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	EML5	Q05BV3	1969 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	XKRY	O14609	159 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	PDCD5	O14737	125 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	DCTD	P32321	178 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	MEP1B	Q16820	701 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341		Q499Y3	187 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	SLC43A2	Q8N370	569 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	OR2T4	Q8NH00	348 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	DMD	P11532	3685 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	REN	P00797	406 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	IFI6	P09912	130 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	DPP4	P27487	766 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	MELK	Q14680	651 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	LRFN5	Q96NI6	719 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	GPR27	Q9NS67	375 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	C7orf66	A4D0T2	115 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	CCR9	P51686	369 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	IFT46	Q9NQC8	304 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SMTN-222	ENST00000612341	GPR171	O14626	319 aa		11.67	□□□□□ -0.54

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms