RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, human

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGEF1-209	ENST00000607882	TRIB1	Q96RU8	372 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882		A0A1B0GUH1	482 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	HCRTR2	O43614	444 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	MAP3K8	P41279	467 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	CRYBB2	P43320	205 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	COTL1	Q14019	142 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	SYPL1	Q16563	259 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNF544	Q6NX49	715 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	TMEM203	Q969S6	136 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	SMIM30	A4D0T7	59 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	MYL12B	O14950	172 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZIC3	O60481	467 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	TBX19	O60806	448 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	GSK3A	P49840	483 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	RORC	P51449	518 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	CLDN20	P56880	219 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	11.25	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	MAPK14	Q16539	360 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	MND1	Q9BWT6	205 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	STUB1	Q9UNE7	303 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	MED12L	Q86YW9	2145 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882		A0A1W2PQ09	198 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	TOX	O94900	526 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	APOL3	O95236	402 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	IGHG3	P01860	377 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	BMP5	P22003	454 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	RFX2	P48378	723 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	FUT5	Q11128	374 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	GPR50	Q13585	617 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	GPAT3	Q53EU6	434 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	CDH26	Q8IXH8	852 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	NEURL3	Q96EH8	262 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	WIPF3	A6NGB9	483 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	CDRT1	O95170	752 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	IL7	P13232	177 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	PSPH	P78330	225 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	EFR3A	Q14156	821 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	SAXO2	Q658L1	398 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	PHC2	Q8IXK0	858 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR2M3	Q8NG83	312 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	SDF2	Q99470	211 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	MMP28	Q9H239	520 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	PIGU	Q9H490	435 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882		M0R3H8	397 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	PRKY	O43930	277 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	CBR3	O75828	277 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	PRF1	P14222	555 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	HK1	P19367	917 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
RABGEF1-209	ENST00000607882	CHRNE	Q04844	493 aa		11.23	□□□□□ -0.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms