RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF175Q9Y473 711 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 UBE2UQ5VVX9 321 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM180AQ6UWF9 173 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 ACBD7Q8N6N7 88 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 MUL1Q969V5 352 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 MND1Q9BWT6 205 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 NDUFA13Q9P0J0 144 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 CAMK2AQ9UQM7 478 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 DCTN6O00399 190 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC16A7O60669 478 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 HIST3H3Q16695 136 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 NADK2Q4G0N4 442 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 OR51L1Q8NGJ5 315 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 MARCH7Q9H992 704 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 EMC3Q9P0I2 261 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM129A0AVI4 362 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 PYCR1P32322 319 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 GLO1Q04760 184 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 CAMK2DQ13557 499 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 KRTCAP3Q53RY4 240 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 ZIC4Q8N9L1 334 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 SYT14Q8NB59 555 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM45BQ96B21 275 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 PRRG4Q9BZD6 226 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 DPPA5A6NC42 116 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 A6NHS1 94 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 MYL12BO14950 172 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF432O94892 652 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2T7P0C7T2 308 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 FCGR2AP12318 317 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 CTLA4P16410 223 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 MAP2K4P45985 399 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 B3GLCTQ6Y288 498 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 NANOGP1Q8N7R0 232 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2T27Q8NH04 317 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNRF4Q8WWF5 429 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2M2Q96R28 347 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 MNTQ99583 582 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 GP6Q9HCN6 339 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 MED12LQ86YW9 2145 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-206ENST00000588815 APOL3O95236 402 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 ADRA2AP08913 450 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM87AP0C7U9 286 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 SHFQ7M4L6 423 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF367Q7RTV3 350 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR141Q7Z602 305 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR137Q96N19 417 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF724A8MTY0 619 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 C12orf71A8MTZ7 269 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC16A9Q7RTY1 509 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM123Q8N131 208 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 FNDC9Q8TBE3 224 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 PRORYQ9H606 182 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 BCO1Q9HAY6 547 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 ERVK13-1Q9NX77 482 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 LIMS3P0CW19 117 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 LIMS4P0CW20 117 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 CSNK1A1P48729 337 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 ETV1P50549 477 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 HSF2Q03933 536 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB39AQ14964 217 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP27.56■■■□□ 22e-10■■■■■ 40.3
CAPNS1-206ENST00000588815 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 SATL1Q86VE3 508 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 WDFY1Q8IWB7 410 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 ABHD3Q8WU67 409 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM54Q969K7 222 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 RERGLQ9H628 205 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 PARPBPQ9NWS1 579 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 GLTPQ9NZD2 209 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 DAPL1A0PJW8 107 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 PTHP01270 115 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 C3AR1Q16581 482 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 TIGD4Q8IY51 512 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 OR10H4Q8NGA5 316 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 OR52N1Q8NH53 320 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 YIPF3Q9GZM5 350 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM192AQ9GZU8 254 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 TAS2R16Q9NYV7 291 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 SVILO95425 2214 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1B0GTH9 108 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 AHRRA9YTQ3 701 aa27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms