RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583254.1

CTC1-211, Transcript of CST telomere replication complex component 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTC1, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1-211ENST00000583254 DEFB121Q5J5C9 76 aa5.86□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 SPATA46Q5T0L3 261 aa5.86□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 AP1ARQ63HQ0 302 aa5.86□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa5.86□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 FRMD7Q6ZUT3 714 aa5.86□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 ZNF627Q7L945 461 aa5.86□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 C6orf120Q7Z4R8 191 aa5.86□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 DDIASQ8IXT1 998 aa5.86□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 C20orf196Q8IYI0 205 aa5.86□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 LYG1Q8N1E2 194 aa5.86□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 CADM2Q8N3J6 435 aa5.86□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 XAGE5Q8WWM1 108 aa5.86□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 OIT3Q8WWZ8 545 aa5.86□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 RAB40AQ8WXH6 277 aa5.86□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 ROPN1LQ96C74 230 aa5.86□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 APOPT1Q96IL0 206 aa5.86□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 OXGR1Q96P68 337 aa5.86□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 EMC6Q9BV81 110 aa5.86□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 ULBP2Q9BZM5 246 aa5.86□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 NANOGQ9H9S0 305 aa5.86□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 TMEM106BQ9NUM4 274 aa5.86□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 SLC17A7Q9P2U7 560 aa5.86□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 LGALS13Q9UHV8 139 aa5.86□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 FBXL3Q9UKT7 428 aa5.86□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 FIS1Q9Y3D6 152 aa5.86□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa5.86□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 GPR45Q9Y5Y3 372 aa5.86□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 RYR1P21817 5038 aa5.86□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 STARD9Q9P2P6 4700 aa5.86□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 PLSCR5A0PG75 271 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 H3BQF6 201 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 M0R082 166 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 SLC28A1O00337 649 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 AZIN1O14977 448 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 LSM1O15116 133 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 TRIM13O60858 407 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 NPIPB7O75200 414 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 MFN2O95140 757 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 AHSA1O95433 338 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 SFTPBP07988 381 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 GKN3PP0CG01 181 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 NEFHP12036 1026 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 UQCRBP14927 111 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 RPS2P15880 293 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 ALDH3A1P30838 453 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 RPS5P46782 204 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 MMP15P51511 669 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 UCP2P55851 309 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 BPIFB3P59826 476 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 NAA20P61599 178 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 HPCAP84074 193 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 PTGR1Q14914 329 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 PCLAFQ15004 111 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 NRN1LQ496H8 165 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 GPAT3Q53EU6 434 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 TTMPQ5BVD1 217 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 ATAD3BQ5T9A4 648 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 ATG16L1Q676U5 607 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 ZNF774Q6NX45 483 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 SKA3Q8IX90 412 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 MREGQ8N565 214 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 OR1J1Q8NGS3 322 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 ZNF417Q8TAU3 575 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 TCP10LQ8TDR4 215 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 SIGLEC11Q96RL6 698 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 PCGF1Q9BSM1 259 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 MECRQ9BV79 373 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 PTDSS2Q9BVG9 487 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 BCL2L14Q9BZR8 327 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 TCF7L2Q9NQB0 619 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 POLE3Q9NRF9 147 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 GIMAP2Q9UG22 337 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 RAB21Q9UL25 225 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 FOXJ3Q9UPW0 622 aa5.85□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 A0A0U1RQK1 487 aa5.84□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa5.84□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa5.84□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 WDR91A4D1P6 747 aa5.84□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 C3orf84H3BNL1 204 aa5.84□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 AIM2O14862 343 aa5.84□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 MGRN1O60291 552 aa5.84□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 TSPAN9O75954 239 aa5.84□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 ZNF205O95201 554 aa5.84□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 SNAP29O95721 258 aa5.84□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 CHEK2O96017 543 aa5.84□□□□□ -1.47
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