RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566882.5

CCNDBP1-210, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 2,746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-210ENST00000566882 NUBPLQ8TB37 319 aa9.14□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF519Q8TB69 540 aa9.14□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 SETD6Q8TBK2 473 aa9.14□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 MR1Q95460 341 aa9.14□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 MED29Q9NX70 200 aa9.14□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa9.14□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 IKZF2Q9UKS7 526 aa9.14□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 G3V3Y1 287 aa9.14□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 ABHD16AO95870 558 aa9.14□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 RAB3BP20337 219 aa9.14□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 CLDN12P56749 244 aa9.14□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 BPIFB3P59826 476 aa9.14□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 RPL27P61353 136 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 RPS18P62269 152 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 SNTA1Q13424 505 aa9.14□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 PCOLCEQ15113 449 aa9.14□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 LRRN1Q6UXK5 716 aa9.14□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 ENKURQ8TC29 256 aa9.14□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 POC1BQ8TC44 478 aa9.14□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 UPRTQ96BW1 309 aa9.14□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 RASL10BQ96S79 203 aa9.14□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM117AQ9C073 453 aa9.14□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 B9D1Q9UPM9 204 aa9.14□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 PRSS37A4D1T9 235 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 ANKUB1A6NFN9 424 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 RENP00797 406 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 UCHL1P09936 223 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 C17orf67Q0P5P2 114 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 EFR3AQ14156 821 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZFP69Q49AA0 526 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 Q5BKY6 102 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM209AQ5JX71 171 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRIQKQ629K1 86 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM198BQ6UWH4 519 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 IZUMO1Q8IYV9 350 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 MS4A15Q8N5U1 240 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 GDPD1Q8N9F7 314 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR2T4Q8NH00 348 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 ABHD1Q96SE0 405 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 EMC6Q9BV81 110 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 LAMP5Q9UJQ1 280 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 XKRYO14609 159 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZFAND5O76080 213 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 AHSA1O95433 338 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC34A2O95436 690 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 EPXP11678 715 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 ALOX5APP20292 161 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 SRP9P49458 86 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 HES5Q5TA89 166 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 PRSS35Q8N3Z0 413 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 SPERTQ8NA61 448 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 DNAAF1Q8NEP3 725 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR8K3Q8NH51 312 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC39A7Q92504 469 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 DEFB126Q9BYW3 111 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC26A1Q9H2B4 701 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 METTL7AQ9H8H3 244 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 RNF121Q9H920 327 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 TTC28Q96AY4 2481 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 A0A1W2PNR3 127 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC22A23A1A5C7 686 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF814B7Z6K7 855 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 DKK1O94907 266 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR6A2O95222 327 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 CER1O95813 267 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 ONECUT2O95948 504 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 IFNGR1P15260 489 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 TATDN3Q17R31 274 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 EMC4Q5J8M3 183 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 MZT2AQ6P582 158 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC23A3Q6PIS1 610 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRILQ7L0X0 811 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 AGBL5Q8NDL9 886 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 C19orf18Q8NEA5 215 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC7A6Q92536 515 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 FRMD6Q96NE9 622 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 INTS14Q96SY0 518 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 TXNIPQ9H3M7 391 aa9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms