RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561514.1

PALB2-202, Transcript of partner and localizer of BRCA2, humanhuman

TSL 5

Gene PALB2, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2-202ENST00000561514 FRS3O43559 492 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 GATCO43716 136 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 TSC22D2O75157 780 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 LY6HO94772 140 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 IGKV3-15P01624 115 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 C1QCP02747 245 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 GPIP06744 558 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 DBIP07108 87 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 TACSTD2P09758 323 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 ATP6V1B1P15313 513 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 BMXP51813 675 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 MVDP53602 400 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 VBP1P61758 197 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 LRRC74AQ0VAA2 488 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 ADIPOQQ15848 244 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 SYPL1Q16563 259 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 TBRG1Q3YBR2 411 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 Q3ZCU0 254 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 HIKESHIQ53FT3 197 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 ESCO2Q56NI9 601 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 FAM120AOSQ5T036 256 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 C9orf135Q5VTT2 229 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 RETREG3Q86VR2 466 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 RNF130Q86XS8 419 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 CDH26Q8IXH8 852 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 PQLC1Q8N2U9 271 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 TMEM99Q8N816 258 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 ZNF781Q8N8C0 355 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 NUP37Q8NFH4 326 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 OR1K1Q8NGR3 316 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 RAB2BQ8WUD1 216 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 CMTM5Q96DZ9 223 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 TEX37Q96LM6 180 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 SLC35A5Q9BS91 424 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 LINC00470Q9BZP3 86 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 C20orf27Q9GZN8 174 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 ZNF442Q9H7R0 627 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 MEAF6Q9HAF1 191 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 UPB1Q9UBR1 384 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 MOKQ9UQ07 419 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 RAP2CQ9Y3L5 183 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 A0A096LPI6 279 aa7.29□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa7.29□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 B2RBV5 119 aa7.29□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 CCRL2O00421 344 aa7.29□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 ZNF432O94892 652 aa7.29□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 AKR7A3O95154 331 aa7.29□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 SNAPINO95295 136 aa7.29□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 PTTG1O95997 202 aa7.29□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 BCL10O95999 233 aa7.29□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 GSNP06396 782 aa7.29□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 PGRP06401 933 aa7.29□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 APEHP13798 732 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 LBPP18428 481 aa7.29□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 CCNA2P20248 432 aa7.29□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 SERPINF1P36955 418 aa7.29□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 OR3A3P47888 321 aa7.29□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 SERPINB10P48595 397 aa7.29□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 RPL14P50914 215 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 NAAAQ02083 359 aa7.29□□□□□ -1.24
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PALB2-202ENST00000561514 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa7.29□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 GPAT3Q53EU6 434 aa7.29□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 FAM205BPQ63HN1 556 aa7.29□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa7.29□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 KLHL24Q6TFL4 600 aa7.29□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 CREB3L2Q70SY1 520 aa7.29□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 LINGO2Q7L985 606 aa7.29□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 AAED1Q7RTV5 226 aa7.29□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 HMGN2P46Q86SG4 172 aa7.29□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 STX12Q86Y82 276 aa7.29□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 EPHX4Q8IUS5 362 aa7.29□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 NUDCD3Q8IVD9 361 aa7.29□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.29□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 ZNF540Q8NDQ6 660 aa7.29□□□□□ -1.24
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PALB2-202ENST00000561514 SVIPQ8NHG7 77 aa7.29□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 FANK1Q8TC84 345 aa7.29□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 FBXO17Q96EF6 278 aa7.29□□□□□ -1.24
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