RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa10.14□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 COQ5Q5HYK3 327 aa10.14□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 ARMC4Q5T2S8 1044 aa10.14□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM166AQ6J272 317 aa10.14□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 IL17RELQ6ZVW7 336 aa10.14□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF540Q8NDQ6 660 aa10.14□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 OR8J3Q8NGG0 315 aa10.14□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 PFN4Q8NHR9 129 aa10.14□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM255BQ8WV15 326 aa10.14□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 C10orf82Q8WW14 230 aa10.14□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 MCHR2Q969V1 340 aa10.14□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF566Q969W8 418 aa10.14□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF347Q96SE7 839 aa10.14□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 RACGAP1Q9H0H5 632 aa10.14□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 LPAR3Q9UBY5 353 aa10.14□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 REV1Q9UBZ9 1251 aa10.14□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 RIMS3Q9UJD0 308 aa10.14□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 SH3GLB1Q9Y371 365 aa10.14□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa10.13□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 OR6A2O95222 327 aa10.13□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 TGFAP01135 160 aa10.13□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 NPPAP01160 153 aa10.13□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 IGF2P01344 180 aa10.13□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 F13BP05160 661 aa10.13□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 OR8G3PP0DMU2 310 aa10.13□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 AQP2P41181 271 aa10.13□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 OR1E2P47887 323 aa10.13□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 FHL1Q13642 323 aa10.13□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 LAPTM4AQ15012 233 aa10.13□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 IQCCQ4KMZ1 466 aa10.13□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 REP15Q6BDI9 236 aa10.13□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 SNX32Q86XE0 403 aa10.13□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 MOSPD2Q8NHP6 518 aa10.13□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 RASSF5Q8WWW0 418 aa10.13□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 ASB10Q8WXI3 467 aa10.13□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 HPS1Q92902 700 aa10.13□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 SYT3Q9BQG1 590 aa10.13□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 SHARPINQ9H0F6 387 aa10.13□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 TPK1Q9H3S4 243 aa10.13□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 KCNS2Q9ULS6 477 aa10.13□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 FZR1Q9UM11 496 aa10.13□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 A4GNTQ9UNA3 340 aa10.13□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa10.13□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 LOC100653049A0A140TA62 436 aa10.12□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa10.12□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 WNT9BO14905 357 aa10.12□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 TRMUO75648 421 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 KRT34O76011 436 aa10.12□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 OR7A10O76100 309 aa10.12□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 OR5F1O95221 314 aa10.12□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 BCL10O95999 233 aa10.12□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 CLPTM1O96005 669 aa10.12□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 CCL2P13500 99 aa10.12□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 ACADSP16219 412 aa10.12□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 KDELR2P33947 212 aa10.12□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 RBM34P42696 430 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 ALDH3B1P43353 468 aa10.12□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP10.12□□□□□ -0.796e-9■■■■■ 32.1
CLSTN3-211ENST00000541667 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 NRN1LQ496H8 165 aa10.12□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM255AQ5JRV8 349 aa10.12□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 LRRC75AQ8NAA5 344 aa10.12□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 OR4K5Q8NGD3 323 aa10.12□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC26A7Q8TE54 656 aa10.12□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM239Q8WW34 195 aa10.12□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM158Q8WZ71 300 aa10.12□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 YIPF5Q969M3 257 aa10.12□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 NABP1Q96AH0 204 aa10.12□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 TSPAN32Q96QS1 320 aa10.12□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 SH3GL1Q99961 368 aa10.12□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 ECSITQ9BQ95 431 aa10.12□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 MS4A5Q9H3V2 200 aa10.12□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 CHODLQ9H9P2 273 aa10.12□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa10.12□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF446Q9NWS9 450 aa10.12□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa10.11□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 CENPBD1B2RD01 187 aa10.11□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 M0R233 179 aa10.11□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 MRASO14807 208 aa10.11□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 MGRN1O60291 552 aa10.11□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 RP2O75695 350 aa10.11□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 NCR1O76036 304 aa10.11□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 RAB36O95755 333 aa10.11□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 IGHG1P01857 330 aa10.11□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 HIST1H2ABP04908 130 aa10.11□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 NAT2P11245 290 aa10.11□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF250P15622 560 aa10.11□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 CHN2P52757 468 aa10.11□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 ARFIP2P53365 341 aa10.11□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 CDH15P55291 814 aa10.11□□□□□ -0.79
CLSTN3-211ENST00000541667 ERVS71-1P61550 626 aa10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.6 ms