RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534730.5

BBS1-224, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 627 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-224	ENST00000534730	BLVRA	P53004	296 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	CRISP1	P54107	249 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	CD47	Q08722	323 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	CAMK2D	Q13557	499 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	FHL1	Q13642	323 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	NRN1L	Q496H8	165 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	FAM122B	Q7Z309	247 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	LUZP2	Q86TE4	346 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM123	Q8N131	208 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	CBR4	Q8N4T8	237 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	TXNDC15	Q96J42	360 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	CIB4	A0PJX0	185 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	PRSS37	A4D1T9	235 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	EI24	O14681	340 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	ARHGEF9	O43307	516 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	PPP1R3D	O95685	299 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	PGA4	P0DJD7	388 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	PGA3	P0DJD8	388 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	NPR2	P20594	1047 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	FAP	Q12884	760 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	PGGHG	Q32M88	737 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF519	Q8TB69	540 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM54	Q969K7	222 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	EMC6	Q9BV81	110 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	NGB	Q9NPG2	151 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	GALNT8	Q9NY28	637 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	POLQ	O75417	2590 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	PDLIM1	O00151	329 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	BHLHE40	O14503	412 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	SOX14	O95416	240 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	COX5A	P20674	150 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	CDK5	Q00535	292 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	NPRL3	Q12980	569 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	MELK	Q14680	651 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	GINS1	Q14691	196 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	CARD17	Q5XLA6	110 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	OR2T4	Q8NH00	348 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	MARVELD3	Q96A59	401 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	MUCL1	Q96DR8	90 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730		Q96M85	177 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	KCNK17	Q96T54	332 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	WAC	Q9BTA9	647 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	CMC2	Q9NRP2	79 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	ZFHX3	Q15911	3703 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	CACNA1C	Q13936	2221 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	SOCS2	O14508	198 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	DHH	O43323	396 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	QDPR	P09417	244 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	FXYD6P3	P58550	94 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	CDC42	P60953	191 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	LGALS3BP	Q08380	585 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	HIST3H3	Q16695	136 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	BOD1	Q96IK1	185 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	FN3K	Q9H479	309 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	CRLF2	Q9HC73	371 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	GPR35	Q9HC97	309 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-224	ENST00000534730	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25

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