RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 IMPA2O14732 288 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ARPC3O15145 178 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 BCL10O95999 233 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 F13BP05160 661 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 CD14P08571 375 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 APEHP13798 732 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 CRYGSP22914 178 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 NOS3P29474 1203 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 CCKARP32238 428 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 P2RY4P51582 365 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 AQP4P55087 323 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 FXYD6P3P58550 94 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 CDK5Q00535 292 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 GINS1Q14691 196 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 SLC17A1Q14916 467 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ACKR1Q16570 336 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 GPR139Q6DWJ6 353 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 HDDC2Q7Z4H3 204 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 LRRC75AQ8NAA5 344 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 RNF128Q8TEB7 428 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 CYGBQ8WWM9 190 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 PERPQ96FX8 193 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF570Q96NI8 536 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 GRIP2Q9C0E4 1043 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 TXNIPQ9H3M7 391 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 RNF122Q9H9V4 155 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 SLC25A19Q9HC21 320 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 GP6Q9HCN6 339 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 NRIP3Q9NQ35 241 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 FAM118AQ9NWS6 357 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 EMC3Q9P0I2 261 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 GRHPRQ9UBQ7 328 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 SEC14L4Q9UDX3 406 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 IL20RAQ9UHF4 553 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ACANP16112 2415 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ZFHX3Q15911 3703 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 A6NIZ1 184 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ZAR1LA6NP61 321 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 FAM171A2A8MVW0 826 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF814B7Z6K7 855 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 MCIDASD6RGH6 385 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 H7C1Q1 480 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 DLGAP1O14490 977 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 SLC16A6O15403 523 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 SERPINI2O75830 405 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 AQP8O94778 261 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 LY6G6DO95868 133 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 PLGP00747 810 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 CGAP01215 116 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 HEXAP06865 529 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 CD8BP10966 210 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 GRK5P34947 590 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 CAPGP40121 348 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 PCYT1AP49585 367 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 DAP3P51398 398 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 SLC16A1P53985 500 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 CDC42P60953 191 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 RAP1BP61224 184 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 RPL27P61353 136 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 RAP1AP62834 184 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ERVK-25P63136 954 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 MYBPC1Q00872 1141 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 PGGHGQ32M88 737 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 SLX4IPQ5VYV7 408 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 FAM205BPQ63HN1 556 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 CASP12Q6UXS9 341 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 THSD4Q6ZMP0 1018 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 SLC35D2Q76EJ3 337 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 FAM214BQ7L5A3 538 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 IGFN1Q86VF2 1251 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 KDM8Q8N371 416 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 LNX2Q8N448 690 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 OR9K2Q8NGE7 335 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 OR8D4Q8NGM9 314 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 PLEKHA8Q96JA3 519 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 HRASLS5Q96KN8 279 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 Q96MF0 132 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 SLC38A2Q96QD8 506 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 MBOAT4Q96T53 435 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 APOL4Q9BPW4 351 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ADI1Q9BV57 179 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 KATNB1Q9BVA0 655 aa10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms