RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 PTHP01270 115 aa12.76□□□□□ -0.37
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SH3BP2-208ENST00000504294 KIF17Q9P2E2 1029 aa12.75□□□□□ -0.37
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SH3BP2-208ENST00000504294 OR2T33Q8NG76 320 aa12.74□□□□□ -0.37
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SH3BP2-208ENST00000504294 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 SLCO4A1Q96BD0 722 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
SH3BP2-208ENST00000504294 SAMD8Q96LT4 415 aa12.73□□□□□ -0.37
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SH3BP2-208ENST00000504294 TBC1D23Q9NUY8 699 aa12.73□□□□□ -0.37
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