RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493752.5

ABCD4-216, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 3

Gene ABCD4, Length 719 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-216ENST00000493752 LINGO2Q7L985 606 aa7.16□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 SSX8Q7RTT4 187 aa7.16□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 P2RY8Q86VZ1 359 aa7.16□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 SYT14Q8NB59 555 aa7.16□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 ACBD4Q8NC06 268 aa7.16□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 STEAP2Q8NFT2 490 aa7.16□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 OR8D4Q8NGM9 314 aa7.16□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 MCHR2Q969V1 340 aa7.16□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 ZNF570Q96NI8 536 aa7.16□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 SNX18Q96RF0 628 aa7.16□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 SLC29A1Q99808 456 aa7.16□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 TEX12Q9BXU0 123 aa7.16□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 C8orf4Q9NR00 106 aa7.16□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa7.16□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 PCNX1Q96RV3 2341 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 CIB4A0PJX0 185 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 TUBAL3A6NHL2 446 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 PRSS44E7EML9 344 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 C19orf84I3L1E1 186 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 SOCS2O14508 198 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 EI24O14681 340 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 DHHO43323 396 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 LYZL6O75951 148 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 ITGA5P08648 1049 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 IGFBP2P18065 325 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 IL32P24001 234 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 GRK5P34947 590 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 RAD23AP54725 363 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 ARF1P84077 181 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 NPRL3Q12980 569 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 TRIP10Q15642 601 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 GABRA6Q16445 453 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 CEACAM16Q2WEN9 425 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 C10orf128Q5T292 105 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 ACSM5Q6NUN0 579 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 ANKRD16Q6P6B7 361 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 ZNF627Q7L945 461 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 JAZF1Q86VZ6 243 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 C17orf78Q8N4C9 275 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 PACRGLQ8N7B6 248 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 NPEPL1Q8NDH3 523 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 NOXO1Q8NFA2 376 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 OR52E2Q8NGJ4 325 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 OR4Q3Q8NH05 313 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 OR4K13Q8NH42 304 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 HSD17B8Q92506 261 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 RASD2Q96D21 266 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 NMNAT3Q96T66 252 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 DDOQ99489 341 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 SPOCK3Q9BQ16 436 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 ULBP2Q9BZM5 246 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 SLC25A19Q9HC21 320 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 SLC24A3Q9HC58 644 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 NDRG3Q9UGV2 375 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 KLHL21Q9UJP4 597 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 ORC6Q9Y5N6 252 aa7.15□□□□□ -1.26
ABCD4-216ENST00000493752 RIIAD1A6NNX1 92 aa7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 RENP00797 406 aa7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 IFNGP01579 166 aa7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 PAX7P23759 505 aa7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 GRNP28799 593 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 CRABP1P29762 137 aa7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 KIR2DL3P43628 341 aa7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 ZNF84P51523 738 aa7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 CD47Q08722 323 aa7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 PGGHGQ32M88 737 aa7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 NRN1LQ496H8 165 aa7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 TIMM23BQ5SRD1 257 aa7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms