RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 LANCL2Q9NS86 450 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 COPZ2Q9P299 210 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 PRODH2Q9UF12 536 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 CHRNA9Q9UGM1 479 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 GNG8Q9UK08 70 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 EFCAB7A8K855 629 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 C9orf172C9J069 976 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 HCRTR2O43614 444 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 UTS2O95399 124 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 CLPSP04118 112 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ELK1P19419 428 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SLC2A5P22732 501 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 MYL9P24844 172 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 RPS27P42677 84 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 RBM34P42696 430 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SLC37A1P57057 533 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 PPP3R1P63098 170 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SERTAD2Q14140 314 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 PON3Q15166 354 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ACSM3Q53FZ2 586 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 CHMP1BQ7LBR1 199 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SAMD12Q8N8I0 201 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 C19orf18Q8NEA5 215 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ABHD4Q8TB40 342 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 MARVELD3Q96A59 401 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 NUDT9Q9BW91 350 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 UBQLN4Q9NRR5 601 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 EXTL2Q9UBQ6 330 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 RASD1Q9Y272 281 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 VSTM2BA6NLU5 285 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 PLA2G10O15496 165 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ICOSLGO75144 302 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 INPP1P49441 399 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 GZMKP49863 264 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 CAPZA1P52907 286 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 RAB25P57735 213 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 KLHL26Q53HC5 615 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ZBTB37Q5TC79 503 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ARHGAP40Q5TG30 622 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 LEG1Q6P5S2 330 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 LINC00114Q6XXX2 140 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 LANCL3Q6ZV70 420 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 OR4D10Q8NGI6 311 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SLC2A12Q8TD20 617 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 KCNE4Q8WWG9 221 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 RNF170Q96K19 258 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 NUDT22Q9BRQ3 303 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 NANSQ9NR45 359 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 FER1L5A0AVI2 2057 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 FAM221AA4D161 298 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 OR6C65A6NJZ3 312 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 H0YIG0 161 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 RPP14O95059 124 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SELLP14151 372 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 CSF2RBP32927 897 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 EVX1P49640 407 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 MEOX2P50222 304 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 CTXN1P60606 82 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 HSD11B2P80365 405 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ACSM1Q08AH1 577 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 QPRTQ15274 297 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 C1QL3Q5VWW1 255 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 OR5M10Q6IEU7 315 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 MZT2AQ6P582 158 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 C17orf107Q6ZR85 190 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ASB18Q6ZVZ8 466 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 MARCH3Q86UD3 253 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SLC35F2Q8IXU6 374 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 GDPD1Q8N9F7 314 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 NKD1Q969G9 470 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 PELI1Q96FA3 418 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 FRMD6Q96NE9 622 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 FOXN4Q96NZ1 517 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
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