RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489742.1

CALM2-208, Transcript of calmodulin 2, human

TSL 3

Gene CALM2, Length 522 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALM2-208	ENST00000489742	SMIM11A	P58511	58 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CALM2-208	ENST00000489742	RAP1B	P61224	184 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CALM2-208	ENST00000489742	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
CALM2-208	ENST00000489742	RAP1A	P62834	184 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CALM2-208	ENST00000489742	DGCR6	Q14129	220 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CALM2-208	ENST00000489742	HIST3H3	Q16695	136 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CALM2-208	ENST00000489742	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CALM2-208	ENST00000489742	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CALM2-208	ENST00000489742	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CALM2-208	ENST00000489742	RNF148	Q8N7C7	305 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CALM2-208	ENST00000489742	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CALM2-208	ENST00000489742	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CALM2-208	ENST00000489742	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CALM2-208	ENST00000489742	MCHR2	Q969V1	340 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CALM2-208	ENST00000489742	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CALM2-208	ENST00000489742	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CALM2-208	ENST00000489742	CDRT15	Q96T59	188 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CALM2-208	ENST00000489742	C1orf198	Q9H425	327 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CALM2-208	ENST00000489742	CD300A	Q9UGN4	299 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CALM2-208	ENST00000489742	DSCAM	O60469	2012 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CALM2-208	ENST00000489742	ROS1	P08922	2347 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	TRIM64B	A6NI03	449 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	PTH	P01270	115 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	NPR2	P20594	1047 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	CALCR	P30988	508 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	NUDT6	P53370	316 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	RAB1A	P62820	205 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	LAPTM4A	Q15012	233 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	EFNB3	Q15768	340 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	SLC36A2	Q495M3	483 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	C10orf128	Q5T292	105 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	PYURF	Q96I23	114 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	RBP7	Q96R05	134 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	FKBP7	Q9Y680	259 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	CELA3B	P08861	270 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	CSF3	P09919	207 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	MAK	P20794	623 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	GIPR	P48546	466 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	CTXN1	P60606	82 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	PIGF	Q07326	219 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	TNK1	Q13470	666 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	DAG1	Q14118	895 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	FGD3	Q5JSP0	725 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	FBXO17	Q96EF6	278 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	NSL1	Q96IY1	281 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	C7orf34	Q96L11	122 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	ZNF347	Q96SE7	839 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	ARPC2	O15144	300 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	SERPINA5	P05154	406 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	HEXA	P06865	529 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	OR4A8	P0C604	315 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	CALB2	P22676	271 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	ACVR1B	P36896	505 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	EFNA4	P52798	201 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	GALK2	Q01415	458 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	HGFAC	Q04756	655 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	RUNX1T1	Q06455	604 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	CD47	Q08722	323 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	ADIPOQ	Q15848	244 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	ZBED5	Q49AG3	693 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	MTX3	Q5HYI7	312 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	THEM4	Q5T1C6	240 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	VHLL	Q6RSH7	139 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	SKA3	Q8IX90	412 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	FITM2	Q8N6M3	262 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	SYT14	Q8NB59	555 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	OR51A7	Q8NH64	312 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
CALM2-208	ENST00000489742	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		13.87	□□□□□ -0.19

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