RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465309.6

LMO7-208, Transcript of LIM domain 7, humanhuman

TSL 3

Gene LMO7, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7-208ENST00000465309 OR8D4Q8NGM9 314 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 NDNFQ8TB73 568 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 CHPT1Q8WUD6 406 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 TMEM255BQ8WV15 326 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 OSTF1Q92882 214 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 SLC41A3Q96GZ6 507 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 TMEM80Q96HE8 168 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 CCDC140Q96MF4 163 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 ZNF426Q9BUY5 554 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 YIPF2Q9BWQ6 316 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 DSN1Q9H410 356 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 SIAEQ9HAT2 523 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 SLC25A19Q9HC21 320 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 C14orf105Q9NVL8 296 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 PRODH2Q9UF12 536 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 DAPK2Q9UIK4 370 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 KCNS2Q9ULS6 477 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 GPR52Q9Y2T5 361 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 PEX16Q9Y5Y5 336 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 ROS1P08922 2347 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 ALPK2Q86TB3 2170 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 A0A0B4J2E0 115 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 A0A1B0GVC2 190 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 A0A1B0GX12 115 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 TMEM89A2RUT3 159 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 TRAPPC13A5PLN9 417 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 FRG2CA6NGY1 282 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 FAM166BA8MTA8 275 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 FAM157AC9JC47 383 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 CDC42EP2O14613 210 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 TO15178 435 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 PIN1P1O15428 100 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 OIP5O43482 229 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 TSPAN2O60636 221 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 SOX14O95416 240 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 NGFRP08138 427 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 FREM3P0C091 2139 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 HSMCR30P0CW71 290 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 ICAM2P13598 275 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 NAT1P18440 290 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 TNNI3P19429 210 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 NR4A1P22736 598 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 TGFBR2P37173 567 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 RFX3P48380 749 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 RGS6P49758 472 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 EMP2P54851 167 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 DEFA1P59665 94 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 DEFA3P59666 94 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 NCS1P62166 190 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 LSM3P62310 102 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 TSPAN31Q12999 210 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 ITGADQ13349 1161 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 FHL1Q13642 323 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 DOC2BQ14184 412 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 IRF3Q14653 427 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 EBPQ15125 230 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 TOMM20Q15388 145 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 NSDHLQ15738 373 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 NNATQ16517 81 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 ZNF181Q2M3W8 571 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 BTBD16Q32M84 506 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 AWAT1Q58HT5 328 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 VAX1Q5SQQ9 334 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 MFSD4BQ5TF39 518 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 CYB5R2Q6BCY4 276 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 POMZP3Q6PJE2 187 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 TMEM205Q6UW68 189 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 ANKRD37Q7Z713 158 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 IGFN1Q86VF2 1251 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 NRMQ8IXM6 262 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 CDK20Q8IZL9 346 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 CLDN22Q8N7P3 220 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 LSMEM1Q8N8F7 131 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 APCDD1LQ8NCL9 501 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 NAXEQ8NCW5 288 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 C7orf57Q8NEG2 295 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 PROKR2Q8NFJ6 384 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 OR52L1Q8NGH7 329 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 OR14A16Q8NHC5 309 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 SLC35B4Q969S0 331 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 CEP19Q96LK0 163 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 MGLLQ99685 303 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 KLHDC3Q9BQ90 382 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 G6PC3Q9BUM1 346 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO7-208ENST00000465309 RTN4RQ9BZR6 473 aa5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms