RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463378.5

RBBP4-208, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 5

Gene RBBP4, Length 882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-208	ENST00000463378	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBBP4-208	ENST00000463378	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBBP4-208	ENST00000463378	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RBBP4-208	ENST00000463378	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBBP4-208	ENST00000463378	SNX24	Q9Y343	169 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBBP4-208	ENST00000463378	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		4.65	□□□□□ -1.66
RBBP4-208	ENST00000463378	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
RBBP4-208	ENST00000463378	DOCK2	Q92608	1830 aa		4.65	□□□□□ -1.66
RBBP4-208	ENST00000463378	TNS2	Q63HR2	1409 aa		4.65	□□□□□ -1.66
RBBP4-208	ENST00000463378	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF253	O75346	499 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	IGHV3-13	P01766	116 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	KITLG	P21583	273 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	VDAC1	P21796	283 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	HSD17B2	P37059	387 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	NCALD	P61601	193 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	PAX2	Q02962	417 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	OR5I1	Q13606	314 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	RUNX3	Q13761	415 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	GNMT	Q14749	295 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	CHRNA6	Q15825	494 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF77	Q15935	545 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	HPS6	Q86YV9	775 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	OR4F6	Q8NGB9	312 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	OR56B4	Q8NH76	319 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	TRIM4	Q9C037	500 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	VCX3B	Q9H321	246 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	MYH3	P11055	1940 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378		A0A1W2PPV9	198 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	TMEM120B	A0PK00	339 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	OR5B21	A6NL26	309 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378		E9PQ18	207 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378		K7ENP7	123 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	SPOP	O43791	374 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	SHBG	P04278	402 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC35E2	P0CK97	266 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	NTS	P30990	170 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	RRM2	P31350	389 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	KIR2DS2	P43631	304 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	SLCO1A2	P46721	670 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	GRB7	Q14451	532 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	ARC	Q7LC44	396 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	SSX9	Q7RTT3	188 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	FAM110B	Q8TC76	370 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	GPR151	Q8TDV0	419 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	KIFAP3	Q92845	792 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	FAM210A	Q96ND0	272 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	TBX15	Q96SF7	602 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	VGLL1	Q99990	258 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	GAL3ST1	Q99999	423 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	GNB4	Q9HAV0	340 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	FANCE	Q9HB96	536 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	LRRC42	Q9Y546	428 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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