RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 EMC3Q9P0I2 261 aa18.52■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa18.52■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 EML5Q05BV3 1969 aa18.51■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa18.51■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 C19orf57Q0VDD7 668 aa18.51■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 METTL11BQ5VVY1 283 aa18.51■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 CDH24Q86UP0 819 aa18.51■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 OTOSQ8NHW6 89 aa18.51■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 NXPE2Q96DL1 559 aa18.51■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 SEC22CQ9BRL7 303 aa18.51■□□□□ 0.55
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IMP4-208ENST00000460766 RNF215Q9Y6U7 377 aa18.51■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa18.51■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 LAMA1P25391 3075 aa18.51■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 RAD52P43351 418 aa18.5■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 LINC00303Q3SY05 128 aa18.5■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 C14orf28Q4W4Y0 310 aa18.5■□□□□ 0.55
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IMP4-208ENST00000460766 NLRC3Q7RTR2 1065 aa18.5■□□□□ 0.55
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IMP4-208ENST00000460766 ELOVL3Q9HB03 270 aa18.5■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 B3GNT2Q9NY97 397 aa18.5■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 STEAP1Q9UHE8 339 aa18.5■□□□□ 0.55
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IMP4-208ENST00000460766 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa18.5■□□□□ 0.55
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IMP4-208ENST00000460766 H3BMH7 237 aa18.5■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 TNFRSF10AO00220 468 aa18.5■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 RAD1O60671 282 aa18.5■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 GP1BBP13224 206 aa18.5■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 KIR3DL2P43630 455 aa18.5■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 OR1D5P58170 312 aa18.5■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 DCAF7P61962 342 aa18.5■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 DMWDQ09019 674 aa18.5■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 MEP1BQ16820 701 aa18.5■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 SIX5Q8N196 739 aa18.5■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 C4orf45Q96LM5 186 aa18.5■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa18.5■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa18.5■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 A0A1W2PQ72 361 aa18.49■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 METTL12A8MUP2 240 aa18.49■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 PHYHO14832 338 aa18.49■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP18.49■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 SLC22A5O76082 557 aa18.49■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 PGCP20142 388 aa18.49■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 HSD11B2P80365 405 aa18.49■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 CBFBQ13951 182 aa18.49■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 ACKR1Q16570 336 aa18.49■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 COL28A1Q2UY09 1125 aa18.49■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 OLFML2AQ68BL7 652 aa18.49■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 OR1L3Q8NH93 324 aa18.49■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 C15orf40Q8WUR7 153 aa18.49■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
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IMP4-208ENST00000460766 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 WWTR1Q9GZV5 400 aa18.49■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 LMAN1LQ9HAT1 526 aa18.49■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 COPS7AQ9UBW8 275 aa18.49■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 ZNF69Q9UC07 566 aa18.49■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa18.49■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 ALG1L2C9J202 215 aa18.49■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 LMO7DNF2Z398 122 aa18.49■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 SUSD5O60279 629 aa18.49■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 SLC16A7O60669 478 aa18.49■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 OR6A2O95222 327 aa18.49■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 LCN1P31025 176 aa18.49■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 CCKBRP32239 447 aa18.49■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 BLVRAP53004 296 aa18.49■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 P2RX3P56373 397 aa18.49■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 C1orf189Q5VU69 101 aa18.49■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 B9D1Q9UPM9 204 aa18.49■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 NPTNQ9Y639 398 aa18.49■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 PRSS37A4D1T9 235 aa18.48■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 TSPAN2O60636 221 aa18.48■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 GLSO94925 669 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 SPARCP09486 303 aa18.48■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 FBLP22087 321 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 ABCD3P28288 659 aa18.48■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP18.48■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 MAMSTRQ6ZN01 415 aa18.48■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 OR51D1Q8NGF3 324 aa18.48■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 MVB12AQ96EY5 273 aa18.48■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 PTDSS2Q9BVG9 487 aa18.48■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa18.48■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 FBXO45P0C2W1 286 aa18.48■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 MNDAP41218 407 aa18.48■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 RPL27P61353 136 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 SGCBQ16585 318 aa18.48■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 SLC29A4Q7RTT9 530 aa18.48■□□□□ 0.55
IMP4-208ENST00000460766 MSANTD3Q96H12 275 aa18.48■□□□□ 0.55
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