RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436287.1

ACTBP11-201, Transcript of actin, beta pseudogene 11, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP11, Length 1,126 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP11-201ENST00000436287 CDH20Q9HBT6 801 aa12.68□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 DECR2Q9NUI1 292 aa12.68□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 TMEM38BQ9NVV0 291 aa12.68□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 SELENONQ9NZV5 590 aa12.68□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 ZIM2Q9NZV7 527 aa12.68□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 PPIAL4EA0A075B759 164 aa12.67□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa12.67□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 A0A0B4J2E0 115 aa12.67□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 A0A1B0GX12 115 aa12.67□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 TRPC5OSA6NMA1 111 aa12.67□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 C5orf58C9J3I9 102 aa12.67□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 PPIAL4DF5H284 164 aa12.67□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 TPST1O60507 370 aa12.67□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 PPIAL4FP0DN26 164 aa12.67□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 PRTN3P24158 256 aa12.67□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 OR1Q1Q15612 314 aa12.67□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 TREML4Q6UXN2 200 aa12.67□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 DPPA2Q7Z7J5 298 aa12.67□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 TREML1Q86YW5 311 aa12.67□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 C10orf53Q8N6V4 93 aa12.67□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa12.67□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 GTF2H4Q92759 462 aa12.67□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 TMEM43Q9BTV4 400 aa12.67□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 OR51B6Q9H340 312 aa12.67□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 C1orf198Q9H425 327 aa12.67□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 SAP30LQ9HAJ7 183 aa12.67□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 TCF7L2Q9NQB0 619 aa12.67□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 DHHO43323 396 aa12.66□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 TPST2O60704 377 aa12.66□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 FARS2O95363 451 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 MT-ATP6P00846 226 aa12.66□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 PTHP01270 115 aa12.66□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 IGHV3-13P01766 116 aa12.66□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 MT-ND5P03915 603 aa12.66□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 ADORA3P0DMS8 318 aa12.66□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 CDH12P55289 794 aa12.66□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 VSNL1P62760 191 aa12.66□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 LCN2P80188 198 aa12.66□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 TSTQ16762 297 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 FAM209AQ5JX71 171 aa12.66□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 NXNQ6DKJ4 435 aa12.66□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 TMEM53Q6P2H8 277 aa12.66□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC35D2Q76EJ3 337 aa12.66□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 DOK3Q7L591 496 aa12.66□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 OR1J2Q8NGS2 313 aa12.66□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 OR5J2Q8NH18 312 aa12.66□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 NFKBIDQ8NI38 313 aa12.66□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 CCL17Q92583 94 aa12.66□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 ELMOD3Q96FG2 381 aa12.66□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 GAL3ST1Q99999 423 aa12.66□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa12.66□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 RNF121Q9H920 327 aa12.66□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 C11orf98E9PRG8 122 aa12.65□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 MFN2O95140 757 aa12.65□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 MAKP20794 623 aa12.65□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF81P51508 661 aa12.65□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 NCALDP61601 193 aa12.65□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 TBC1D28Q2M2D7 210 aa12.65□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 KRT71Q3SY84 523 aa12.65□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC36A2Q495M3 483 aa12.65□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 NRN1LQ496H8 165 aa12.65□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 REEP3Q6NUK4 255 aa12.65□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 KRT73Q86Y46 540 aa12.65□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 LRRC17Q8N6Y2 441 aa12.65□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 OR4K5Q8NGD3 323 aa12.65□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 OR9I1Q8NGQ6 314 aa12.65□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF566Q969W8 418 aa12.65□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 WFDC6Q9BQY6 131 aa12.65□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa12.65□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 LRMDAQ9H2I8 198 aa12.65□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 THAP1Q9NVV9 213 aa12.65□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 TAS2R5Q9NYW4 299 aa12.65□□□□□ -0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 PRORSD1PA6NEY8 169 aa12.64□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 POM121CA8CG34 1229 aa12.64□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 FOXH1O75593 365 aa12.64□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 UBOX5O94941 541 aa12.64□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 OR6A2O95222 327 aa12.64□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 IGHV1-46P01743 117 aa12.64□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 QDPRP09417 244 aa12.64□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 DRD4P21917 467 aa12.64□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 CDK6Q00534 326 aa12.64□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 GLO1Q04760 184 aa12.64□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 PLP2Q04941 152 aa12.64□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC3A1Q07837 685 aa12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms