RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	GIPR	P48546	466 aa		15.28	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	15.28	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	EVX1	P49640	407 aa		15.28	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	TAS2R41	P59536	307 aa		15.28	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	GUCY1A3	Q02108	690 aa		15.28	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	15.28	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	FXN	Q16595	210 aa		15.28	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	LIPN	Q5VXI9	398 aa		15.28	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	DEF8	Q6ZN54	512 aa		15.28	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		15.28	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		15.28	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	SKA3	Q8IX90	412 aa		15.28	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	CDK20	Q8IZL9	346 aa		15.28	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		15.28	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		15.28	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		15.28	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	15.28	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		15.28	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	15.28	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	CHODL	Q9H9P2	273 aa		15.28	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		15.28	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		15.28	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		15.28	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		15.28	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	CENPBD1	B2RD01	187 aa		15.27	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		15.27	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	15.27	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	OR7A10	O76100	309 aa		15.27	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	RAB36	O95755	333 aa		15.27	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	BCL10	O95999	233 aa		15.27	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	IGHG1	P01857	330 aa		15.27	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		15.27	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	FUT1	P19526	365 aa		15.27	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	HNF1A	P20823	631 aa		15.27	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	GLRX	P35754	106 aa		15.27	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	15.27	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	RUNX1T1	Q06455	604 aa		15.27	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	15.27	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	NRN1L	Q496H8	165 aa		15.27	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		15.27	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		15.27	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	15.27	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	OR2T12	Q8NG77	320 aa		15.27	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM239	Q8WW34	195 aa		15.27	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	15.27	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	15.27	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	15.27	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	CMAHP	Q9Y471	501 aa		15.27	■□□□□ 0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	ENTPD5	O75356	428 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	STAMBP	O95630	424 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	SERPINA5	P05154	406 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	QDPR	P09417	244 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	PATE4	P0C8F1	98 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	GIF	P27352	417 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	SELENOW	P63302	87 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	GGTLC2	Q14390	218 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	RAB39A	Q14964	217 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	15.26	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	MICU2	Q8IYU8	434 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	ASB10	Q8WXI3	467 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	MCHR2	Q969V1	340 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	SGTB	Q96EQ0	304 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF347	Q96SE7	839 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	CMTM6	Q9NX76	183 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	ARMCX1	Q9P291	453 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		15.26	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		15.25	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		15.25	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	F13B	P05160	661 aa		15.25	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		15.25	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		15.25	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		15.25	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		15.25	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	15.25	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	RCN3	Q96D15	328 aa		15.25	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	PRRC1	Q96M27	445 aa		15.25	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	SH3GL3	Q99963	347 aa		15.25	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	MED31	Q9Y3C7	131 aa		15.25	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		15.25	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1W2PRG6	482 aa		15.24	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		15.24	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	SYNGR3	O43761	229 aa		15.24	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	DAO	P14920	347 aa		15.24	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	ACADS	P16219	412 aa		15.24	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF23	P17027	643 aa		15.24	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	AQP2	P41181	271 aa		15.24	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	CLRN1	P58418	232 aa		15.24	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	C10orf128	Q5T292	105 aa		15.24	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		15.24	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		15.24	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		15.24	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF786	Q8N393	782 aa		15.24	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		15.24	■□□□□ 0.03

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