RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428101.6

LMO1-202, Transcript of LIM domain only 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO1, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1-202ENST00000428101 ZNF23P17027 643 aa23.45■■□□□ 1.34
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LMO1-202ENST00000428101 OR1E2P47887 323 aa23.45■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 TAS2R41P59536 307 aa23.45■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 RUNX1T1Q06455 604 aa23.45■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 HIST3H3Q16695 136 aa23.45■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 DEF8Q6ZN54 512 aa23.45■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 SH3GL3Q99963 347 aa23.45■■□□□ 1.34
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LMO1-202ENST00000428101 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 OR7A10O76100 309 aa23.44■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 OR5F1O95221 314 aa23.44■■□□□ 1.34
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LMO1-202ENST00000428101 F13BP05160 661 aa23.44■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 FUT1P19526 365 aa23.44■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 IGFBP5P24593 272 aa23.44■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 MAPRE2Q15555 327 aa23.44■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 ZNF786Q8N393 782 aa23.44■■□□□ 1.34
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LMO1-202ENST00000428101 SOX7Q9BT81 388 aa23.44■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 FBXL3Q9UKT7 428 aa23.44■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa23.43■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 IGF2P01344 180 aa23.43■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 IGHG1P01857 330 aa23.43■■□□□ 1.34
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LMO1-202ENST00000428101 SGTBQ96EQ0 304 aa23.43■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 ZNF347Q96SE7 839 aa23.43■■□□□ 1.34
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LMO1-202ENST00000428101 ZNF446Q9NWS9 450 aa23.43■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 LPAR3Q9UBY5 353 aa23.43■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 LRP5LA4QPB2 252 aa23.42■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 FAM220BPB1ANY3 271 aa23.42■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 SYNGR3O43761 229 aa23.42■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 IFNA14P01570 189 aa23.42■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 VIMP08670 466 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 TSPAN19P0C672 248 aa23.42■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 AQP2P41181 271 aa23.42■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 CLRN1P58418 232 aa23.42■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 GALK2Q01415 458 aa23.42■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 CYBRD1Q53TN4 286 aa23.42■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa23.42■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 OR4K5Q8NGD3 323 aa23.42■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 ASB10Q8WXI3 467 aa23.42■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 SYT3Q9BQG1 590 aa23.42■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 SHARPINQ9H0F6 387 aa23.42■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 GID8Q9NWU2 228 aa23.42■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 REV1Q9UBZ9 1251 aa23.42■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 KCNS2Q9ULS6 477 aa23.42■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 A0A1W2PRG6 482 aa23.41■■□□□ 1.34
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LMO1-202ENST00000428101 MYBPC1Q00872 1141 aa23.41■■□□□ 1.34
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LMO1-202ENST00000428101 SLC7A8Q9UHI5 535 aa23.41■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 FZR1Q9UM11 496 aa23.41■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 RNF212BA8MTL3 300 aa23.4■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 LYNX1G3V0Z9 82 aa23.4■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 M0R233 179 aa23.4■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 ENTPD5O75356 428 aa23.4■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 TRMUO75648 421 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
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LMO1-202ENST00000428101 LYNX1P0DP58 116 aa23.4■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 THRBP10828 461 aa23.4■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 ALDH3B1P43353 468 aa23.4■■□□□ 1.34
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LMO1-202ENST00000428101 SYT14Q8NB59 555 aa23.4■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 NOXO1Q8NFA2 376 aa23.4■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 OR2T12Q8NG77 320 aa23.4■■□□□ 1.34
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LMO1-202ENST00000428101 INIPQ9NRY2 104 aa23.4■■□□□ 1.34
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LMO1-202ENST00000428101 ACADSP16219 412 aa23.39■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 IL2RGP31785 369 aa23.39■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 SEC24CP53992 1094 aa23.39■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 GUCY1A3Q02108 690 aa23.39■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 NRN1LQ496H8 165 aa23.39■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 ARMC4Q5T2S8 1044 aa23.39■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 MICU2Q8IYU8 434 aa23.39■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 SLC30A7Q8NEW0 376 aa23.39■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 MS4A5Q9H3V2 200 aa23.39■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 ARMCX1Q9P291 453 aa23.39■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 A4GNTQ9UNA3 340 aa23.39■■□□□ 1.33
LMO1-202ENST00000428101 MED31Q9Y3C7 131 aa23.39■■□□□ 1.33
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