RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PITPNAQ00169 270 aa16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MELKQ14680 651 aa16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HSPB2Q16082 182 aa16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TTC9Q92623 222 aa16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARL5BQ96KC2 179 aa16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VDAC3Q9Y277 283 aa16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HRH3Q9Y5N1 445 aa16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ALG5Q9Y673 324 aa16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CENPXA8MT69 81 aa16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MEN1O00255 615 aa16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HLA-DOBP13765 273 aa16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SOX2P48431 317 aa16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CENPAP49450 140 aa16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BLVRAP53004 296 aa16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DLX5P56178 289 aa16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NDUFA5Q16718 116 aa16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STAC2Q6ZMT1 411 aa16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRSS35Q8N3Z0 413 aa16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 YIPF5Q969M3 257 aa16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NXPE2Q96DL1 559 aa16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DMRTB1Q96MA1 342 aa16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZFP3Q96NJ6 502 aa16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KLRF1Q9NZS2 232 aa16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYOTQ9UBF9 498 aa16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CAMK2AQ9UQM7 478 aa16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CACNG2Q9Y698 323 aa16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 V9GY05 133 aa16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM172BPA6NC97 362 aa16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM212A6NML5 194 aa16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ORC5O43913 435 aa16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF254O75437 659 aa16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZFAND5O76080 213 aa16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PUDPQ08623 228 aa16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FOXF1Q12946 379 aa16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ETFDHQ16134 617 aa16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC36A2Q495M3 483 aa16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC35D2Q76EJ3 337 aa16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRT74Q7RTS7 529 aa16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KDM8Q8N371 416 aa16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CREB3L1Q96BA8 519 aa16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR8B4Q96RC9 309 aa16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COMMD4Q9H0A8 199 aa16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TCF7L1Q9HCS4 588 aa16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM127O75204 238 aa16.83■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CD3GP09693 182 aa16.83■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SRP9P49458 86 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DGCR2P98153 550 aa16.83■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa16.83■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MEP1BQ16820 701 aa16.83■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLA1AQ53H76 456 aa16.83■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LYPD8Q6UX82 237 aa16.83■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRRN1Q6UXK5 716 aa16.83■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CMTM4Q8IZR5 234 aa16.83■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF676Q8N7Q3 588 aa16.83■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MFSD8Q8NHS3 518 aa16.83■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ASB17Q8WXJ9 295 aa16.83■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RNF170Q96K19 258 aa16.83■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLITRK2Q9H156 845 aa16.83■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LIN7BQ9HAP6 207 aa16.83■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MS4A18H0YCH9 400 aa16.82■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GDF9O60383 454 aa16.82■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR2J2O76002 312 aa16.82■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF432O94892 652 aa16.82■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADRB1P08588 477 aa16.82■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPARCP09486 303 aa16.82■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FGF5P12034 268 aa16.82■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DPP4P27487 766 aa16.82■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCKBRP32239 447 aa16.82■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BTCP35070 178 aa16.82■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MFSD13AQ14CX5 517 aa16.82■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR7A5Q15622 319 aa16.82■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MS4A18Q3C1V0 323 aa16.82■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM69BQ5VUD6 431 aa16.82■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF248Q8NDW4 579 aa16.82■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR10AC1Q8NH08 325 aa16.82■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C4orf45Q96LM5 186 aa16.82■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DCBLD2Q96PD2 775 aa16.82■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ELOVL3Q9HB03 270 aa16.82■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa16.82■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PATE3B3GLJ2 98 aa16.82■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa16.82■□□□□ 0.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61 ms