RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 TXNDC12O95881 172 aa26.39■■□□□ 1.82
PKDCC-202ENST00000401498 APEHP13798 732 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
PKDCC-202ENST00000401498 ANXA8P13928 327 aa26.39■■□□□ 1.82
PKDCC-202ENST00000401498 RPS6KA3P51812 740 aa26.39■■□□□ 1.82
PKDCC-202ENST00000401498 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
PKDCC-202ENST00000401498 HIKESHIQ53FT3 197 aa26.39■■□□□ 1.82
PKDCC-202ENST00000401498 GPR139Q6DWJ6 353 aa26.39■■□□□ 1.82
PKDCC-202ENST00000401498 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa26.39■■□□□ 1.82
PKDCC-202ENST00000401498 P2RY8Q86VZ1 359 aa26.39■■□□□ 1.82
PKDCC-202ENST00000401498 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
PKDCC-202ENST00000401498 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
PKDCC-202ENST00000401498 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
PKDCC-202ENST00000401498 PKP2Q99959 881 aa26.39■■□□□ 1.82
PKDCC-202ENST00000401498 IFT27Q9BW83 186 aa26.39■■□□□ 1.82
PKDCC-202ENST00000401498 S100A14Q9HCY8 104 aa26.39■■□□□ 1.82
PKDCC-202ENST00000401498 REV1Q9UBZ9 1251 aa26.39■■□□□ 1.82
PKDCC-202ENST00000401498 SOX14O95416 240 aa26.38■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa26.38■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 WDR31Q8NA23 367 aa26.38■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 ALG12Q9BV10 488 aa26.38■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF226Q9NYT6 803 aa26.38■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 A0A1W2PR80 420 aa26.37■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 G3V2T6 193 aa26.37■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 CASKO14936 926 aa26.37■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 ARPC3O15145 178 aa26.37■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 DHHO43323 396 aa26.37■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 FMODQ06828 376 aa26.37■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 CD47Q08722 323 aa26.37■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 ANKRD16Q6P6B7 361 aa26.37■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa26.37■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 HIPK1Q86Z02 1210 aa26.37■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 C17orf78Q8N4C9 275 aa26.37■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 ATG16L2Q8NAA4 619 aa26.37■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 OR52N5Q8NH56 324 aa26.37■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 SLC17A5Q9NRA2 495 aa26.37■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 A0A096LPE4 126 aa26.37■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa26.37■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 A0A1W2PPZ6 126 aa26.37■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 H7C1C5 153 aa26.37■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 SEC14L2O76054 403 aa26.37■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF23P17027 643 aa26.37■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 CRYGSP22914 178 aa26.37■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 LCN6P62502 163 aa26.37■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 TBRG1Q3YBR2 411 aa26.37■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 FAHD1Q6P587 224 aa26.37■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 WFDC8Q8IUA0 241 aa26.37■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 OR52L1Q8NGH7 329 aa26.37■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF556Q9HAH1 456 aa26.37■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 POFUT2Q9Y2G5 429 aa26.37■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 SLC25A15Q9Y619 301 aa26.37■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 BHLHE40O14503 412 aa26.36■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 SOCS2O14508 198 aa26.36■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 XKRYO14609 159 aa26.36■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 SLC2A10O95528 541 aa26.36■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 DAPP51397 102 aa26.36■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 PPA1Q15181 289 aa26.36■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 ALKBH2Q6NS38 261 aa26.36■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 PTCHD4Q6ZW05 846 aa26.36■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF627Q7L945 461 aa26.36■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa26.36■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 MUCL1Q96DR8 90 aa26.36■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 FOXB1Q99853 325 aa26.36■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 TBC1D23Q9NUY8 699 aa26.36■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 PRSS37A4D1T9 235 aa26.35■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 IMPA2O14732 288 aa26.35■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 SIAH2O43255 324 aa26.35■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 PRF1P14222 555 aa26.35■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 SLC36A3Q495N2 470 aa26.35■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 THEM4Q5T1C6 240 aa26.35■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 C10orf128Q5T292 105 aa26.35■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa26.35■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 SVOPLQ8N434 492 aa26.35■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 C14orf79Q96F83 325 aa26.35■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 RBP7Q96R05 134 aa26.35■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 TSSK6Q9BXA6 273 aa26.35■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 SMURF2Q9HAU4 748 aa26.35■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 OAZ3Q9UMX2 235 aa26.35■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 FBN2P35556 2912 aa26.35■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 SLC22A23A1A5C7 686 aa26.34■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 A6NNC1 897 aa26.34■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 FNDC8Q8TC99 324 aa26.34■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 FAM221AA4D161 298 aa26.33■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 DEFB108AA8MXU0 73 aa26.33■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 IDH3BO43837 385 aa26.33■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 NR2C1P13056 603 aa26.33■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 B4GALT1P15291 398 aa26.33■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF813Q6ZN06 617 aa26.33■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 ADCK1Q86TW2 530 aa26.33■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 ICA1LQ8NDH6 482 aa26.33■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 STMN2Q93045 179 aa26.33■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa26.33■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 KIF17Q9P2E2 1029 aa26.33■■□□□ 1.81
PKDCC-202ENST00000401498 AHCYL1O43865 530 aa26.33■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.9 ms