RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 IDH3BO43837 385 aa26.19■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 APEHP13798 732 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 SELENOPP49908 381 aa26.19■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 ARMC4Q5T2S8 1044 aa26.19■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 NIPAL3Q6P499 406 aa26.19■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC120Q96HB5 630 aa26.19■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 SIGLEC11Q96RL6 698 aa26.19■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 PARPBPQ9NWS1 579 aa26.19■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa26.19■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 EFCAB10A6NFE3 127 aa26.18■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 HTR1AP08908 422 aa26.18■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 PIPP12273 146 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
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ECHS1-201ENST00000368547 SLC15A1P46059 708 aa26.18■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 OR6K3Q8NGY3 331 aa26.18■■□□□ 1.78
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ECHS1-201ENST00000368547 RCE1Q9Y256 329 aa26.18■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa26.17■■□□□ 1.78
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ECHS1-201ENST00000368547 ZNF432O94892 652 aa26.17■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 NOS3P29474 1203 aa26.17■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 ACVR1BP36896 505 aa26.17■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 CAMK2DQ13557 499 aa26.17■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 GPR139Q6DWJ6 353 aa26.17■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 PRSS48Q7RTY5 328 aa26.17■■□□□ 1.78
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ECHS1-201ENST00000368547 OR6X1Q8NH79 312 aa26.17■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF519Q8TB69 540 aa26.17■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 GGHQ92820 318 aa26.17■■□□□ 1.78
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ECHS1-201ENST00000368547 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 OR2M2Q96R28 347 aa26.17■■□□□ 1.78
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ECHS1-201ENST00000368547 SNX5Q9Y5X3 404 aa26.17■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 ALPK2Q86TB3 2170 aa26.17■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa26.17■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 DPPA5A6NC42 116 aa26.17■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 M0R3G1 203 aa26.17■■□□□ 1.78
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ECHS1-201ENST00000368547 RGS10O43665 173 aa26.17■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 EDNRAP25101 427 aa26.17■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 ALDH3B2P48448 385 aa26.17■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 ADORA2A-AS1P86434 159 aa26.17■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 RUNX1T1Q06455 604 aa26.17■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa26.17■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 CARD17Q5XLA6 110 aa26.17■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 BTLAQ7Z6A9 289 aa26.17■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa26.17■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 SGCDQ92629 289 aa26.17■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 STARD4Q96DR4 205 aa26.17■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 COPS4Q9BT78 406 aa26.17■■□□□ 1.78
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ECHS1-201ENST00000368547 IMPA2O14732 288 aa26.16■■□□□ 1.78
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ECHS1-201ENST00000368547 NUDT6P53370 316 aa26.16■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 AADACL4Q5VUY2 407 aa26.16■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 NXNL2Q5VZ03 156 aa26.16■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF100Q8IYN0 542 aa26.16■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM123Q8N131 208 aa26.16■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 RFKQ969G6 155 aa26.16■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 APH1AQ96BI3 265 aa26.16■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 RIIAD1A6NNX1 92 aa26.15■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 BMP5P22003 454 aa26.15■■□□□ 1.78
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ECHS1-201ENST00000368547 MESTQ5EB52 335 aa26.15■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 MTFR2Q6P444 385 aa26.15■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 AHSA2Q719I0 299 aa26.15■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 HDDC2Q7Z4H3 204 aa26.15■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 ERVK-18Q9QC07 812 aa26.15■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 KLHL21Q9UJP4 597 aa26.15■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP26.15■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 GPR52Q9Y2T5 361 aa26.15■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 IL18BPO95998 194 aa26.14■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF3P17036 446 aa26.14■■□□□ 1.78
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ECHS1-201ENST00000368547 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 FAM205BPQ63HN1 556 aa26.14■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 KCTD8Q6ZWB6 473 aa26.14■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 AMBNQ9NP70 447 aa26.14■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa26.14■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 SLC5A6Q9Y289 635 aa26.14■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 PCNX1Q96RV3 2341 aa26.14■■□□□ 1.77
ECHS1-201ENST00000368547 A6NIZ1 184 aa26.14■■□□□ 1.77
ECHS1-201ENST00000368547 XKRYO14609 159 aa26.14■■□□□ 1.77
ECHS1-201ENST00000368547 ARHGEF9O43307 516 aa26.14■■□□□ 1.77
ECHS1-201ENST00000368547 SLC43A1O75387 559 aa26.14■■□□□ 1.77
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