RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356183.8

GTF3C1-201, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF3C1, Length 7,018 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1-201ENST00000356183 CD80P33681 288 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 PCBD1P61457 104 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 DEFB133Q30KQ1 61 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 KDM4DQ6B0I6 523 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 LPCAT3Q6P1A2 487 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 SLC17A9Q9BYT1 436 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 SYT5O00445 386 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 PHOX2AO14813 284 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 C1QBP02746 253 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 RABIFP47224 123 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 GLYATL3Q5SZD4 288 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 OR2T2Q6IF00 324 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 LSMEM2Q8N112 164 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 OR52E1Q8NGJ3 308 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 PAAF1Q9BRP4 392 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 WDR76Q9H967 626 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 NQO2P16083 231 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 ITGB7P26010 798 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 DUSP1P28562 367 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 AANATQ16613 207 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 LCN15Q6UWW0 184 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 TMEM255BQ8WV15 326 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 PTDSS2Q9BVG9 487 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 SCML1Q9UN30 329 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 RFPL4AA6NLU0 287 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 RAB5AP20339 215 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 SRPXP78539 464 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 TSPAN31Q12999 210 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 FAM74A1Q5RGS3 127 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 TMEFF1Q8IYR6 380 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 ZNF566Q969W8 418 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 TRIM77I1YAP6 450 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 SLC16A6O15403 523 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 CALCBP10092 127 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 CALCRP30988 508 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 ZNF813Q6ZN06 617 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 RHOUQ7L0Q8 258 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 LFNGQ8NES3 379 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 FAM3DQ96BQ1 224 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 VAMP8Q9BV40 100 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 TPSD1Q9BZJ3 242 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 BANF2Q9H503 90 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 NALCNQ8IZF0 1738 aa10.2□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 CIDEAO60543 219 aa10.19□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 ACHEP22303 614 aa10.19□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 RAB7AP51149 207 aa10.19□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 HES1Q14469 280 aa10.19□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 CEBPEQ15744 281 aa10.19□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 FAM26DQ5JW98 314 aa10.19□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 OPN5Q6U736 354 aa10.19□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 AKR1E2Q96JD6 320 aa10.19□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 OR8B4Q96RC9 309 aa10.19□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 PIGLQ9Y2B2 252 aa10.19□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 CORINQ9Y5Q5 1042 aa10.19□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 SLC22A7Q9Y694 548 aa10.19□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 PHLPP1O60346 1717 aa10.19□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 EFSO43281 561 aa10.19□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 DDAH2O95865 285 aa10.19□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 DTYMKP23919 212 aa10.19□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 P2RY2P41231 377 aa10.19□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 CLDN22Q8N7P3 220 aa10.19□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa10.19□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 C5AR1P21730 350 aa10.19□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 FABP9Q0Z7S8 132 aa10.19□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 ZNF528Q3MIS6 628 aa10.19□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 CLEC14AQ86T13 490 aa10.19□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 TCEAL8Q8IYN2 117 aa10.19□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 SLC22A24Q8N4F4 322 aa10.19□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 ANKLE1Q8NAG6 615 aa10.19□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 ARSGQ96EG1 525 aa10.19□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 ZNF840PA6NDX5 716 aa10.19□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 HBQ1P09105 142 aa10.19□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 FABP4P15090 132 aa10.19□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 CLDN2P57739 230 aa10.19□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 EDDM3AQ14507 147 aa10.19□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 ZNF626Q68DY1 528 aa10.19□□□□□ -0.78
GTF3C1-201ENST00000356183 VWA1Q6PCB0 445 aa10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms