RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 TIMP4Q99727 224 aa16.07■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 JAM3Q9BX67 310 aa16.07■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 PRRG4Q9BZD6 226 aa16.07■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 EMC3Q9P0I2 261 aa16.07■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 KLHL9Q9P2J3 617 aa16.07■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 RCE1Q9Y256 329 aa16.07■□□□□ 0.16
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SYNE4-201ENST00000324444 SLC22A23A1A5C7 686 aa16.06■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 CYSRT1A8MQ03 144 aa16.06■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 AGFG2O95081 481 aa16.06■□□□□ 0.16
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SYNE4-201ENST00000324444 HLA-DOBP13765 273 aa16.06■□□□□ 0.16
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SYNE4-201ENST00000324444 OR52I1Q8NGK6 324 aa16.06■□□□□ 0.16
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SYNE4-201ENST00000324444 PLSCR2Q9NRY7 297 aa16.06■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF175Q9Y473 711 aa16.06■□□□□ 0.16
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SYNE4-201ENST00000324444 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa16.05■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa16.05■□□□□ 0.16
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SYNE4-201ENST00000324444 NHLRC1Q6VVB1 395 aa16.05■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 ZBTB46Q86UZ6 589 aa16.05■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 ACBD7Q8N6N7 88 aa16.05■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 BBS1Q8NFJ9 593 aa16.05■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa16.05■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 WDYHV1Q96HA8 205 aa16.05■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 TAAR6Q96RI8 345 aa16.05■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 MND1Q9BWT6 205 aa16.05■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 PRDM14Q9GZV8 571 aa16.05■□□□□ 0.16
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SYNE4-201ENST00000324444 ASB6Q9NWX5 421 aa16.05■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa16.05■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa16.05■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF407Q9C0G0 2248 aa16.05■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC182A6NF36 153 aa16.04■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 OR6C65A6NJZ3 312 aa16.04■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 MYL12BO14950 172 aa16.04■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 HTR1AP08908 422 aa16.04■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 OR2T7P0C7T2 308 aa16.04■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 GSTT1P30711 240 aa16.04■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 ALDH3B2P48448 385 aa16.04■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 HSF2Q03933 536 aa16.04■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 GLO1Q04760 184 aa16.04■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa16.04■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 MCEMP1Q8IX19 187 aa16.04■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 OR51G2Q8NGK0 314 aa16.04■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 OR6K6Q8NGW6 343 aa16.04■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 OR2T27Q8NH04 317 aa16.04■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 ZPLD1Q8TCW7 415 aa16.04■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 ACOT13Q9NPJ3 140 aa16.04■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 MED29Q9NX70 200 aa16.04■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 B9D1Q9UPM9 204 aa16.04■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 CAMK2AQ9UQM7 478 aa16.04■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa16.04■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 DNAJC13O75165 2243 aa16.04■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa16.03■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa16.03■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 SLC35F4A4IF30 521 aa16.03■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 IGHA1P01876 353 aa16.03■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 SBK2P0C263 348 aa16.03■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 CLDN17P56750 224 aa16.03■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 IRF3Q14653 427 aa16.03■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa16.03■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF367Q7RTV3 350 aa16.03■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 GPR141Q7Z602 305 aa16.03■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 SIAH3Q8IW03 269 aa16.03■□□□□ 0.16
SYNE4-201ENST00000324444 GHDCQ8N2G8 530 aa16.03■□□□□ 0.16
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