RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 HCRTR2O43614 444 aa13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 IL9P15248 144 aa13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 PI3P19957 117 aa13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 CNR1P21554 472 aa13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 CXCR1P25024 350 aa13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 MAOBP27338 520 aa13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 DIO1P49895 249 aa13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 EFNB1P98172 346 aa13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 OR1J4Q8NGS1 313 aa13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 OR2L8Q8NGY9 312 aa13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 CD300LFQ8TDQ1 290 aa13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 C5orf34Q96MH7 638 aa13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 PRSS27Q9BQR3 290 aa13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 C2orf42Q9NWW7 574 aa13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 MOKQ9UQ07 419 aa13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 GGT3PA6NGU5 568 aa13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 BET1O15155 118 aa13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 WDPCPO95876 746 aa13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 RAB5BP61020 215 aa13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 PLA2G7Q13093 441 aa13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 MEP1BQ16820 701 aa13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 OR2W3Q7Z3T1 314 aa13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 LINC00518Q8N0U6 118 aa13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 OR9A4Q8NGU2 314 aa13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 CCL4L1Q8NHW4 92 aa13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 SCPEP1Q9HB40 452 aa13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 FAM96BQ9Y3D0 163 aa13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa13.96□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 A0A0D9SG52 128 aa13.96□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 METTL21EPA6NDL7 271 aa13.96□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 TRIM77I1YAP6 450 aa13.96□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 CTSEP14091 401 aa13.96□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 ZNF823P16415 610 aa13.96□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 TAS2R19P59542 299 aa13.96□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 ZNF616Q08AN1 781 aa13.96□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 CST6Q15828 149 aa13.96□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 C2orf76Q3KRA6 126 aa13.96□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 CNKSR3Q6P9H4 555 aa13.96□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 SLC16A13Q7RTY0 426 aa13.96□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 GABRG1Q8N1C3 465 aa13.96□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 SPICQ8N5J4 248 aa13.96□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 OR1S1Q8NH92 325 aa13.96□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 PNPLA2Q96AD5 504 aa13.96□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 SHARPINQ9H0F6 387 aa13.96□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 PIPOXQ9P0Z9 390 aa13.96□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 STEAP1Q9UHE8 339 aa13.96□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 HELZP42694 1942 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 CEP250Q9BV73 2442 aa13.96□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 PIN1P1O15428 100 aa13.96□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 HTR3BO95264 441 aa13.96□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 CD53P19397 219 aa13.96□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 BDKRB2P30411 391 aa13.96□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 GPR85P60893 370 aa13.96□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP13.96□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 MLC1Q15049 377 aa13.96□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 NKAPLQ5M9Q1 402 aa13.96□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 MANEAQ5SRI9 462 aa13.96□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 PPP1R14AQ96A00 147 aa13.96□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 PHB2Q99623 299 aa13.96□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 CFHR5Q9BXR6 569 aa13.96□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 SEC61A2Q9H9S3 476 aa13.96□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 I3L1I5 382 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 NME2P22392 152 aa13.96□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 OR3A2P47893 321 aa13.96□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 KCNJ3P48549 501 aa13.96□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 ATP1B3P54709 279 aa13.96□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 BAMBIQ13145 260 aa13.96□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa13.96□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa13.96□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 CSNK1A1LQ8N752 337 aa13.96□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 OR13C3Q8NGS6 347 aa13.96□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 PATE1Q8WXA2 126 aa13.96□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 SLC22A18Q96BI1 424 aa13.96□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 DGAT2Q96PD7 388 aa13.96□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 DAPP1Q9UN19 280 aa13.96□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 S1PR1P21453 382 aa13.95□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 GUCA2BQ16661 112 aa13.95□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 SYS1Q8N2H4 156 aa13.95□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 ZNF285Q96NJ3 590 aa13.95□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 SERINC2Q96SA4 455 aa13.95□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 FAM86C1Q9NVL1 165 aa13.95□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 INSL6Q9Y581 213 aa13.95□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa13.95□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 TUBAL3A6NHL2 446 aa13.95□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 PRSS44E7EML9 344 aa13.95□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 SULT1B1O43704 296 aa13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms