RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264010.8

CTCF-201, Transcript of CCCTC-binding factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCF, Length 3,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCF-201ENST00000264010 FAM27D1Q5T7N8 215 aa14.85□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa14.85□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 ZNF227Q86WZ6 799 aa14.85□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 OR8S1Q8NH09 359 aa14.85□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 SMIM19Q96E16 107 aa14.85□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 TMEM43Q9BTV4 400 aa14.85□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 SERINC1Q9NRX5 453 aa14.85□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 CACNG2Q9Y698 323 aa14.85□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 A0A0G2JMP0 313 aa14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 A0A0X1KG70 313 aa14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 OR2T1O43869 369 aa14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 PIAS2O75928 621 aa14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 VAMP1P23763 118 aa14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 VWA2Q5GFL6 755 aa14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 CHRDL2Q6WN34 429 aa14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 OR4M2Q8NGB6 313 aa14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 OR14A2Q96R54 314 aa14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 JAM3Q9BX67 310 aa14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 SLC25A18Q9H1K4 315 aa14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 B4DXG7 233 aa14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 SIGLEC5O15389 551 aa14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 C1QBP02746 253 aa14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 GALNSP34059 522 aa14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 DNASE1L1P49184 302 aa14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 NXPH1P58417 271 aa14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 SIGLEC14Q08ET2 396 aa14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 SLC16A9Q7RTY1 509 aa14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 MARCH3Q86UD3 253 aa14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 HLA-CQ95604 372 aa14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 ST6GAL2Q96JF0 529 aa14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 SFXN2Q96NB2 322 aa14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 SDHAF3Q9NRP4 125 aa14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 FABP1P07148 127 aa14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 TBXA2RP21731 343 aa14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 P2RY14Q15391 338 aa14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 C9orf152Q5JTZ5 239 aa14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 CASTOR1Q8WTX7 329 aa14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 ACOXLQ9NUZ1 547 aa14.84□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 SPTBP11277 2137 aa14.83□□□□□ -0.03
CTCF-201ENST00000264010 H7C1C5 153 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 RGS13O14921 159 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 CFIP05156 583 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 GUSBP08236 651 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 CTRB1P17538 263 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 SDHAP31040 664 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 MNDAP41218 407 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 LCN6P62502 163 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 IL10RAQ13651 578 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 PHF19Q5T6S3 580 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 CYB5R2Q6BCY4 276 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 CTRB2Q6GPI1 263 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 TMPRSS12Q86WS5 348 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 OR5L2Q8NGL0 311 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 LPAR4Q99677 370 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 NIPAL2Q9H841 368 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 ICAM5Q9UMF0 924 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 C2orf16Q68DN1 1984 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 ICOSLGO75144 302 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 KLHL24Q6TFL4 600 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 SPEM1Q8N4L4 309 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 LINC00469Q8N7U9 141 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 NKD1Q969G9 470 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 DDOQ99489 341 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 ORAI3Q9BRQ5 295 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 MRI1Q9BV20 369 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 NOX4Q9NPH5 578 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 V9GY05 133 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 ACOD1A6NK06 481 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 LEUTXA8MZ59 168 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 KRBOX1C9JBD0 128 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 OR10A3P58181 314 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 SLC18B1Q6NT16 456 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 TMEM81Q6P7N7 255 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 TMEM91Q6ZNR0 172 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 COMMD2Q86X83 199 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 OR13C5Q8NGS8 318 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 OIT3Q8WWZ8 545 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 METTL7AQ9H8H3 244 aa14.83□□□□□ -0.04
CTCF-201ENST00000264010 SUSD2Q9UGT4 822 aa14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.8 ms