RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580654.5

SMARCE1-217, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-217ENST00000580654 C6orf47O95873 294 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 AK1P00568 194 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 MT-ND5P03915 603 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 SERPINA5P05154 406 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 LCKP06239 509 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 WNT2P09544 360 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 UROSP10746 265 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 PNMTP11086 282 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 B4GALT1P15291 398 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF81P51508 661 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 SELENOVP59797 346 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 SLC3A1Q07837 685 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 MFSD13AQ14CX5 517 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 HERPUD1Q15011 391 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 TEX35Q5T0J7 233 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 CLEC6AQ6EIG7 209 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 C6orf89Q6UWU4 347 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 LRRN1Q6UXK5 716 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF813Q6ZN06 617 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 RNF130Q86XS8 419 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 CLEC4FQ8N1N0 589 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 KLHL36Q8N4N3 616 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 SPICQ8N5J4 248 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF519Q8TB69 540 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 SFXN5Q8TD22 340 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 DCAKDQ8WVC6 231 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 SSMEM1Q8WWF3 244 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 RAB40AQ8WXH6 277 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 OR5P2Q8WZ92 322 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 CFHR4Q92496 578 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 MTERF3Q96E29 417 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 L3HYPDHQ96EM0 354 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 SIGLEC11Q96RL6 698 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 C1orf109Q9NX04 203 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 TMEM216Q9P0N5 145 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 ATP6V1HQ9UI12 483 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 STK38LQ9Y2H1 464 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 HERC2O95714 4834 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 A6NJY4 79 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 CEACAM18A8MTB9 384 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 C3orf84H3BNL1 204 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 XPNPEP2O43895 674 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 MGRN1O60291 552 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 MFN2O95140 757 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 TGDSO95455 350 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 GUSBP08236 651 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 ADH4P08319 380 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF43P17038 809 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 MATN1P21941 496 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 IER3P46695 156 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 PRKAA2P54646 552 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 FGF12P61328 243 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 BTG1P62324 171 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 RBBP4Q09028 425 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 EPS8Q12929 822 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 CHI3L2Q15782 390 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 FAM153CQ494X1 144 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 SPDYE7PQ495Y7 208 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 ESCO2Q56NI9 601 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 C1orf140Q5VVS0 124 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 LIPMQ5VYY2 423 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 BTNL3Q6UXE8 466 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 CREG2Q8IUH2 290 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 SKA3Q8IX90 412 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 C20orf196Q8IYI0 205 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 PIK3C3Q8NEB9 887 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 SLC30A7Q8NEW0 376 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 TBC1D15Q8TC07 691 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 OIT3Q8WWZ8 545 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 C11orf40Q8WZ69 217 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 PTDSS2Q9BVG9 487 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 TAPBPLQ9BX59 468 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 OR51I1Q9H343 314 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 TCF7L2Q9NQB0 619 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 TMEM106BQ9NUM4 274 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 FOXJ3Q9UPW0 622 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 LRCH1Q9Y2L9 728 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 WDR45Q9Y484 360 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 A8MVM7 634 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 FZD7O75084 574 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 UBL3O95164 117 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 SFTPBP07988 381 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 CD55P08174 381 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-217ENST00000580654 TFPTP0C1Z6 253 aa6.37□□□□□ -1.39
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